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dc.contributor.author
Cacciabue, Marco Polo Domingo
dc.contributor.author
Aguilera, Pablo Nicolas
dc.contributor.author
Gismondi, Maria Ines
dc.contributor.author
Taboga, Oscar Alberto
dc.date.available
2021-04-06T20:25:33Z
dc.date.issued
2020-08-21
dc.identifier.citation
Cacciabue, Marco Polo Domingo; Aguilera, Pablo Nicolas; Gismondi, Maria Ines; Taboga, Oscar Alberto; Covidex: an ultrafast and accurate tool for virus subtyping; Cold Spring Harbor Laboratory Press; bioRxiv; 2020; 21-8-2020; 1-5
dc.identifier.issn
2692-8205
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/129481
dc.description.abstract
Covidex is an open-source, alignment-free machine learning subtyping tool for viral species. It is a shiny app that allows a fast and accurate classification in pre-defined clusters for SARS-CoV-2 and FMDV genome sequences. The user can also build its own classification models with the Covidex model generator.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Cold Spring Harbor Laboratory Press
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
SARS-CoV-2
dc.subject
SUBTYPING
dc.subject
MACHINE LEARNING
dc.subject
COVID-19
dc.subject.classification
Ciencias de la Información y Bioinformática
dc.subject.classification
Ciencias de la Computación e Información
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.subject.classification
Virología
dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.title
Covidex: an ultrafast and accurate tool for virus subtyping
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2021-04-05T14:48:51Z
dc.journal.volume
2020
dc.journal.pagination
1-5
dc.journal.pais
Estados Unidos
dc.description.fil
Fil: Cacciabue, Marco Polo Domingo. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Universidad Nacional de Luján. Departamento de Ciencias Básicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Aguilera, Pablo Nicolas. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina. Universidad Nacional de Luján. Departamento de Ciencias Básicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Gismondi, Maria Ines. Universidad Nacional de Luján. Departamento de Ciencias Básicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Taboga, Oscar Alberto. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación En Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Agrobiotecnología y Biología Molecular; Argentina
dc.journal.title
bioRxiv
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://doi.org/10.1101/2020.08.21.261347
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.08.21.261347v1
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Tamaño:
839.9Kb
Formato:
PDF