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Covidex: an ultrafast and accurate tool for virus subtyping

Cacciabue, Marco Polo DomingoIcon ; Aguilera, Pablo NicolasIcon ; Gismondi, Maria InesIcon ; Taboga, Oscar AlbertoIcon
Fecha de publicación: 21/08/2020
Editorial: Cold Spring Harbor Laboratory Press
Revista: bioRxiv
ISSN: 2692-8205
Idioma: Inglés
Tipo de recurso: Artículo publicado
Clasificación temática:

Resumen

Covidex is an open-source, alignment-free machine learning subtyping tool for viral species. It is a shiny app that allows a fast and accurate classification in pre-defined clusters for SARS-CoV-2 and FMDV genome sequences. The user can also build its own classification models with the Covidex model generator.
Palabras clave: SARS-CoV-2 , SUBTYPING , MACHINE LEARNING , COVID-19
 
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Identificadores
URI: http://hdl.handle.net/11336/129481
DOI: https://doi.org/10.1101/2020.08.21.261347
URL: https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.08.21.261347v1
Colecciones
Articulos (IABIMO)
Articulos de INSTITUTO DE AGROBIOTECNOLOGIA Y BIOLOGIA MOLECULAR
Citación
Cacciabue, Marco Polo Domingo; Aguilera, Pablo Nicolas; Gismondi, Maria Ines; Taboga, Oscar Alberto; Covidex: an ultrafast and accurate tool for virus subtyping; Cold Spring Harbor Laboratory Press; bioRxiv; 2020; 21-8-2020; 1-5
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