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dc.contributor.author
Fernandez, Jose Jesus  
dc.contributor.author
Torres Molina, Teobaldo Enrique  
dc.contributor.author
Martin Solana, Eva  
dc.contributor.author
Goya, Gerardo Fabian  
dc.contributor.author
Fernandez Fernandez, Maria Rosario  
dc.date.available
2021-02-23T12:51:55Z  
dc.date.issued
2020-03  
dc.identifier.citation
Fernandez, Jose Jesus; Torres Molina, Teobaldo Enrique; Martin Solana, Eva; Goya, Gerardo Fabian; Fernandez Fernandez, Maria Rosario; PolishEM: Image enhancement in FIB-SEM; Oxford University Press; Bioinformatics (Oxford, England); 36; 12; 3-2020; 3947-3948  
dc.identifier.issn
1367-4803  
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/126303  
dc.description.abstract
We have developed a software tool to improve the image quality in focused ion beam-scanning electron microscopy (FIB-SEM) stacks: PolishEM. Based on a Gaussian blur model, it automatically estimates and compensates for the blur affecting each individual image. It also includes correction for artifacts commonly arising in FIB-SEM (e.g. curtaining). PolishEM has been optimized for an efficient processing of huge FIB-SEM stacks on standard computers.  
dc.format
application/pdf  
dc.language.iso
eng  
dc.publisher
Oxford University Press  
dc.rights
info:eu-repo/semantics/restrictedAccess  
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/  
dc.subject
FIB-SEM  
dc.subject
IMAGE ENHANCEMENT  
dc.subject
CELLS  
dc.subject
ELECTRON MICROSCOPY  
dc.subject.classification
Ciencias de la Información y Bioinformática  
dc.subject.classification
Ciencias de la Computación e Información  
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS  
dc.title
PolishEM: Image enhancement in FIB-SEM  
dc.type
info:eu-repo/semantics/article  
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo  
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion  
dc.date.updated
2021-02-22T12:50:29Z  
dc.journal.volume
36  
dc.journal.number
12  
dc.journal.pagination
3947-3948  
dc.journal.pais
Reino Unido  
dc.journal.ciudad
Oxford  
dc.description.fil
Fil: Fernandez, Jose Jesus. Consejo Superior de Investigaciones Científicas; España  
dc.description.fil
Fil: Torres Molina, Teobaldo Enrique. Universidad de Zaragoza. Instituto de Nanociencia de Aragón; España. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte; Argentina  
dc.description.fil
Fil: Martin Solana, Eva. Consejo Superior de Investigaciones Científicas; España  
dc.description.fil
Fil: Goya, Gerardo Fabian. Universidad de Zaragoza. Instituto de Nanociencia de Aragón; España  
dc.description.fil
Fil: Fernandez Fernandez, Maria Rosario. Consejo Superior de Investigaciones Científicas; España  
dc.journal.title
Bioinformatics (Oxford, England)  
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://academic.oup.com/bioinformatics/advance-article/doi/10.1093/bioinformatics/btaa218/5813331  
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btaa218  

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Formato: PDF
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