| Lugar de trabajo |
CONSEJO NACIONAL DE INVESTIGACIONES CIENTIFICAS Y TECNICAS / OFICINA DE COORDINACION ADMINISTRATIVA HOUSSAY / INSTITUTO DE QUIMICA Y FISICOQUIMICA BIOLOGICAS "PROF. ALEJANDRO C. PALADINI" | UNIVERSIDAD DE BUENOS AIRES / FACULTAD DE FARMACIA Y BIOQUIMICA / INSTITUTO DE QUIMICA Y FISICOQUIMICA BIOLOGICAS "PROF. ALEJANDRO C. PALADINI" |
| Título |
Doctor en Farmacia y Bioquímica |
| Grado |
Universitario de posgrado/doctorado |
| Especialidad |
Estudio de docking de la bomba de calcio de membrana plasmática de glóbulo rojo (PMCA4b) con el reactivo fotoactivable AS86. La PMCA4b se modeló por homología con el software de modelado molecular Chimera con la opción Modeller incorporada en el programa mencionado frente a la bomba de calcio de retículo endoplásmico SERCA como templado. Para realizar el docking se usaron el AutoDock Tools y el AutoDock Vina. La opción obabel permitió transformar los archivos.pdbqt en archivos.pdb para ser visualizados con Chimera. La misma metodología se aplicó a un análogo del AS86 sin grupo azido fotoactivable. Por otra parte se empleó la técnica de docking descripta precedentemente con las distintas conformaciones de la SERCA: 1WIO, 1SU4 y 2AVG con Epigallocatequina, Epigallocatequina-3-galato y Quercetina. Se analizaron en todos los estudios de docking, la distribución de las conformaciones de los diferentes ligandos con los receptores mencionados y los puentes de hidrógeno formados. Se hizo un estudio de docking con la PMCA 4b modelada por homología utilizando Chimera, Hyperchem y Vina con ligandos de estructura flavonoides. Se analizó en sitio activo donde se aloja el sustrato ATP y se superpusieron los ligandos sobre el sustrato con el objeto de mdefinir si ellos ocupan el mismo sitio del sustrato. |
