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dc.contributor.author
Marques Da Silva, Wanderson
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dc.contributor.author
Bei, Jinlong
dc.contributor.author
Amigo, Natalia
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dc.contributor.author
Valacco, Maria Pia
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dc.contributor.author
Amadio, Ariel Fernando
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dc.contributor.author
Zhang, Qi
dc.contributor.author
Wu, Xiuju
dc.contributor.author
Yu, Ting
dc.contributor.author
Larzabal, Mariano
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dc.contributor.author
Chen, Zhuang
dc.contributor.author
Cataldi, Ángel Adrián
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dc.date.available
2019-12-23T18:10:14Z
dc.date.issued
2018-12
dc.identifier.citation
Marques Da Silva, Wanderson; Bei, Jinlong; Amigo, Natalia; Valacco, Maria Pia; Amadio, Ariel Fernando; et al.; Quantification of enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7 protein abundance by high-throughput proteome; Public Library of Science; Plos One; 13; 12; 12-2018; 1-15
dc.identifier.issn
1932-6203
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/92824
dc.description.abstract
Enterohemorrhagic Escherichia coli (EHEC) O157:H7 is a human pathogen responsible fordiarrhea, hemorrhagic colitis and hemolytic uremic syndrome (HUS). To promote a comprehensiveinsight into the molecular basis of EHEC O157:H7 physiology and pathogenesis,the combined proteome of EHEC O157:H7 strains, Clade 8 and Clade 6 isolated from cattlein Argentina, and the standard EDL933 (clade 3) strain has been analyzed. From shotgunproteomic analysis a total of 2,644 non-redundant proteins of EHEC O157:H7 were identified,which correspond approximately 47% of the predicted proteome of this pathogen. Normalizedspectrum abundance factor analysis was performed to estimate the proteinabundance. According this analysis, 50 proteins were detected as the most abundant ofEHEC O157:H7 proteome. COG analysis showed that the majority of the most abundantproteins are associated with translation processes. A KEGG enrichment analysis revealedthat Glycolysis / Gluconeogenesis was the most significant pathway. On the other hand, theless abundant detected proteins are those related to DNA processes, cell respiration andprophage. Among the proteins that composed the Type III Secretion System, the mostabundant protein was EspA. Altogether, the results show a subset of important proteins thatcontribute to physiology and pathogenicity of EHEC O157:H7.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Public Library of Science
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
proteome
dc.subject
E coli
dc.subject
quantitative
dc.subject
Mass spec
dc.subject.classification
Bioquímica y Biología Molecular
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
Quantification of enterohemorrhagic Escherichia coli O157:H7 protein abundance by high-throughput proteome
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2019-12-20T21:11:32Z
dc.journal.volume
13
dc.journal.number
12
dc.journal.pagination
1-15
dc.journal.pais
Estados Unidos
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dc.journal.ciudad
San Francisco
dc.description.fil
Fil: Marques Da Silva, Wanderson. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina
dc.description.fil
Fil: Bei, Jinlong. Guangdong Academy Of Agricultural Sciences; China
dc.description.fil
Fil: Amigo, Natalia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina
dc.description.fil
Fil: Valacco, Maria Pia. Universidad de Buenos Aires; Argentina
dc.description.fil
Fil: Amadio, Ariel Fernando. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires; Argentina
dc.description.fil
Fil: Zhang, Qi. Guangdong Academy Of Agricultural Sciences; China
dc.description.fil
Fil: Wu, Xiuju. Guangdong Academy Of Agricultural Sciences; China
dc.description.fil
Fil: Yu, Ting. Guangdong Academy Of Agricultural Sciences; China
dc.description.fil
Fil: Larzabal, Mariano. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires; Argentina
dc.description.fil
Fil: Chen, Zhuang. Guangdong Academy Of Agricultural Sciences; China
dc.description.fil
Fil: Cataldi, Ángel Adrián. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires; Argentina
dc.journal.title
Plos One
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0208520
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0208520
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