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dc.contributor.author
Martini, Johannes W. R.  
dc.contributor.author
Schrauf, Matías Florián  
dc.contributor.author
García Baccino, Carolina Andrea  
dc.contributor.author
Pimentel, Eduardo C. G.  
dc.contributor.author
Munilla Leguizamon, Sebastian  
dc.contributor.author
Rogberg Muñoz, Andres  
dc.contributor.author
Cantet, Rodolfo Juan Carlos  
dc.contributor.author
Reimer, Christian  
dc.contributor.author
Gao, Ning  
dc.contributor.author
Wimmer, Valentin  
dc.contributor.author
Simianer, Henner  
dc.date.available
2019-12-04T19:52:46Z  
dc.date.issued
2018-04  
dc.identifier.citation
Martini, Johannes W. R.; Schrauf, Matías Florián; García Baccino, Carolina Andrea; Pimentel, Eduardo C. G.; Munilla Leguizamon, Sebastian; et al.; The effect of the H -1 scaling factors τ and ω on the structure of H in the single-step procedure; BioMed Central; Genetics Selection Evolution; 50; 1; 4-2018; 1-9  
dc.identifier.issn
1297-9686  
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/91410  
dc.description.abstract
Background: The single-step covariance matrix H combines the pedigree-based relationship matrix A with the more accurate information on realized relatedness of genotyped individuals represented by the genomic relationship matrix G. In particular, to improve convergence behavior of iterative approaches and to reduce inflation, two weights ℑ and ω have been introduced in the definition of H-1, which blend the inverse of a part of A with the inverse of G . Since the definition of this blending is based on the equation describing H-1, its impact on the structure of H is not obvious. In a joint discussion, we considered the question of the shape of H for non-trivial ℑ and ω. Results: Here, we present the general matrix H as a function of these parameters and discuss its structure and properties. Moreover, we screen for optimal values of ℑ and ω with respect to predictive ability, inflation and iterations up to convergence on a well investigated, publicly available wheat data set. Conclusion: Our results may help the reader to develop a better understanding for the effects of changes of ℑ and ω on the covariance model. In particular, we give theoretical arguments that as a general tendency, inflation will be reduced by increasing ℑ or by decreasing ω.  
dc.format
application/pdf  
dc.language.iso
eng  
dc.publisher
BioMed Central  
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess  
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/  
dc.subject
SINGLE STEP  
dc.subject
TUNING PARAMETERS  
dc.subject
GENOMIC SELECTION  
dc.subject
MATRIX INVERSE  
dc.subject.classification
Genética y Herencia  
dc.subject.classification
Ciencias Biológicas  
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS  
dc.subject.classification
Otras Biotecnología Agropecuaria  
dc.subject.classification
Biotecnología Agropecuaria  
dc.subject.classification
CIENCIAS AGRÍCOLAS  
dc.subject.classification
Estadística y Probabilidad  
dc.subject.classification
Matemáticas  
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS  
dc.title
The effect of the H -1 scaling factors τ and ω on the structure of H in the single-step procedure  
dc.type
info:eu-repo/semantics/article  
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo  
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion  
dc.date.updated
2019-10-18T19:07:46Z  
dc.journal.volume
50  
dc.journal.number
1  
dc.journal.pagination
1-9  
dc.journal.pais
Reino Unido  
dc.journal.ciudad
Londres  
dc.description.fil
Fil: Martini, Johannes W. R.. KWS SAAT SE; Alemania  
dc.description.fil
Fil: Schrauf, Matías Florián. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Departamento de Producción Animal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina  
dc.description.fil
Fil: García Baccino, Carolina Andrea. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Departamento de Producción Animal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina  
dc.description.fil
Fil: Pimentel, Eduardo C. G.. Bavarian State Research Center for Agriculture; Alemania  
dc.description.fil
Fil: Munilla Leguizamon, Sebastian. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Departamento de Producción Animal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina  
dc.description.fil
Fil: Rogberg Muñoz, Andres. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Departamento de Producción Animal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina  
dc.description.fil
Fil: Cantet, Rodolfo Juan Carlos. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Agronomía. Departamento de Producción Animal; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Unidad Ejecutora de Investigaciones en Producción Animal. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias. Unidad Ejecutora de Investigaciones en Producción Animal; Argentina  
dc.description.fil
Fil: Reimer, Christian. University of Goettingen; Alemania  
dc.description.fil
Fil: Gao, Ning. University of Goettingen; Alemania. South China Agricultural University; China  
dc.description.fil
Fil: Wimmer, Valentin. KWS SAAT SE; Alemania  
dc.description.fil
Fil: Simianer, Henner. University of Goettingen; Alemania  
dc.journal.title
Genetics Selection Evolution  
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1186/s12711-018-0386-x  
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://gsejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12711-018-0386-x