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dc.contributor.author
Soto, Axel Juan
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dc.contributor.author
Przybyla, Piotr
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dc.contributor.author
Ananiadou, Sophia
dc.date.available
2019-11-29T18:30:16Z
dc.date.issued
2018-05-15
dc.identifier.citation
Soto, Axel Juan; Przybyla, Piotr; Ananiadou, Sophia; Thalia: Semantic search engine for biomedical abstracts; Oxford University Press; Bioinformatics (Oxford, England); 35; 10; 15-5-2018; 1799-1801
dc.identifier.issn
1367-4803
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/90965
dc.description.abstract
While publication rate of the biomedical literature has been growing steadily during the last decades, the accessibility of pertinent research publications for biologist and medical practitioners remains a challenge. This paper describes Thalia, which is a semantic search engine that can recognize eight different types of concepts occurring in biomedical abstracts. Thalia is available via a web-based interface or a RESTful API. A key aspect of our search engine is that it is updated from PubMed on a daily basis. We describe here the main building blocks of our tool as well as an evaluation of the retrieval capabilities of Thalia in the context of a precision medicine dataset.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Oxford University Press
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
dc.subject
RESTFUL API
dc.subject
THALIA
dc.subject
SEMANTIC SEARCH ENGINE
dc.subject
PRECISION MEDICINE DATASET
dc.subject.classification
Ciencias de la Información y Bioinformática
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dc.subject.classification
Ciencias de la Computación e Información
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
Thalia: Semantic search engine for biomedical abstracts
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2019-10-23T17:33:28Z
dc.journal.volume
35
dc.journal.number
10
dc.journal.pagination
1799-1801
dc.journal.pais
Reino Unido
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dc.journal.ciudad
Oxford
dc.description.fil
Fil: Soto, Axel Juan. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca; Argentina. University of Manchester; Reino Unido
dc.description.fil
Fil: Przybyla, Piotr. University of Manchester; Reino Unido
dc.description.fil
Fil: Ananiadou, Sophia. University of Manchester; Reino Unido
dc.journal.title
Bioinformatics (Oxford, England)
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://academic.oup.com/bioinformatics/advance-article/doi/10.1093/bioinformatics/bty871/5134063
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/bty871
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6513154/
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