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dc.contributor.author
Vázquez Prieto, Severo
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dc.contributor.author
Paniagua Crespo, María Esperanza
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dc.contributor.author
Solana, Hugo Daniel
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dc.contributor.author
Ubeira, Florencio
dc.date.available
2019-10-23T19:40:45Z
dc.date.issued
2018-02
dc.identifier.citation
Vázquez Prieto, Severo; Paniagua Crespo, María Esperanza; Solana, Hugo Daniel; Ubeira, Florencio ; Complex network study of the immune epitope database for parasitic organisms; Bentham Science Publishers; Current Topics in Medicinal Chemistry; 17; 30; 2-2018; 1-7
dc.identifier.issn
1568-0266
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/87151
dc.description.abstract
Abstract: Background: Complex network approach allows the representation and analysis of complexsystems of interacting agents in an ordered and effective manner, thus increasing the probability of discoveringsignificant properties of them. In the present study, we defined and built for the first time acomplex network based on data obtained from Immune Epitope Database for parasitic organisms. Wethen considered the general topology, the node degree distribution, and the local structure (triadic census)of this network. In addition, we calculated 9 node centrality measures for observed network and reporteda comparative study of the real network with three theoretical models to detect similarities or deviationsfrom these ideal networks.Result: The results obtained corroborate the utility of the complex network approach for handling informationand data mining within the database under study.Conclusion: They confirm that this type of approach can be considered a valuable tool for preliminaryscreening of the best experimental conditions to determine whether the amino acid sequences beingstudied are true epitopes or not.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Bentham Science Publishers
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
NETWORK THEORY
dc.subject
TOPOLOGICAL INDICES
dc.subject
B-CELLS EPITOPES
dc.subject
IMMUNE EPITOPE DATABASE
dc.subject
PARASITIC ORGANISMS
dc.subject.classification
Ciencias de la Información y Bioinformática
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dc.subject.classification
Ciencias de la Computación e Información
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
Complex network study of the immune epitope database for parasitic organisms
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2019-10-21T20:01:02Z
dc.journal.volume
17
dc.journal.number
30
dc.journal.pagination
1-7
dc.journal.pais
Estados Unidos
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.description.fil
Fil: Vázquez Prieto, Severo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; Argentina
dc.description.fil
Fil: Paniagua Crespo, María Esperanza. Universidad de Santiago de Compostela; España
dc.description.fil
Fil: Solana, Hugo Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tandil. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comision de Investigaciones Científicas. Centro de Investigación Veterinaria de Tandil; Argentina
dc.description.fil
Fil: Ubeira, Florencio. Universidad de Santiago de Compostela; España
dc.journal.title
Current Topics in Medicinal Chemistry
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://www.eurekaselect.com/158202/article
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.2174/1568026618666171211150605
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29231143
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