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dc.contributor.author
Mogni, Virginia Yanina
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dc.contributor.author
Kahan, Mariano Ariel
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dc.contributor.author
de Queiroz, Luciano Paganucci
dc.contributor.author
Vesprini, Jose Luis
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dc.contributor.author
Ortiz, Juan Pablo Amelio
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dc.contributor.author
Prado, Darien Eros
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dc.date.available
2019-09-26T19:01:45Z
dc.date.issued
2016-12
dc.identifier.citation
Mogni, Virginia Yanina; Kahan, Mariano Ariel; de Queiroz, Luciano Paganucci; Vesprini, Jose Luis; Ortiz, Juan Pablo Amelio; et al.; Optimization of DNA extraction and PCR protocols for phylogenetic analysis in Schinopsis spp. and related Anacardiaceae; SpringerOpen; SpringerPlus; 5; 1; 12-2016; 1-7
dc.identifier.issn
2193-1801
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/84556
dc.description.abstract
The Anacardiaceae is an important and worldwide distributed family of ecological and socio-economic relevance. Notwithstanding that, molecular studies in this family are scarce and problematic because of the particularly high concentration of secondary metabolites—i.e. tannins and oleoresins—that are present in almost all tissues of the many members of the group, which complicate the purification and amplification of the DNA. The objective of this work was to improve an available DNA isolation method for Schinopsis spp. and other related Anacardiaceae, as well as the PCR protocols for DNA amplification of the chloroplast trnL-F, rps16 and ndhF and nuclear ITS–ETS fragments. The modifications proposed allowed the extraction of 70–120 µg of non-degraded genomic DNA per gram of dry tissue that resulted useful for PCR amplification. PCR reactions produced the expected fragments that could be directly sequenced. Sequence analyses of amplicons showed similarity with the corresponding Schinopsis accessions available at GenBank. The methodology presented here can be routinely applied for molecular studies of the group aimed to clarify not only aspects on the molecular biology but also the taxonomy and phylogeny of this fascinating group of vascular plants.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
SpringerOpen
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
ANACARDIACEAE
dc.subject
DNA ISOLATION
dc.subject
PHYLOGENY
dc.subject
SCHINOPSIS
dc.subject
SEQUENCING
dc.subject.classification
Bioquímica y Biología Molecular
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.subject.classification
Ciencias de las Plantas, Botánica
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
Optimization of DNA extraction and PCR protocols for phylogenetic analysis in Schinopsis spp. and related Anacardiaceae
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2019-09-23T17:10:16Z
dc.journal.volume
5
dc.journal.number
1
dc.journal.pagination
1-7
dc.journal.pais
Alemania
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dc.journal.ciudad
Berlin
dc.description.fil
Fil: Mogni, Virginia Yanina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario; Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina
dc.description.fil
Fil: Kahan, Mariano Ariel. SINERGIUM Biotech; Argentina
dc.description.fil
Fil: de Queiroz, Luciano Paganucci. Universidade Estadual de Feira de Santana; Brasil
dc.description.fil
Fil: Vesprini, Jose Luis. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario; Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina
dc.description.fil
Fil: Ortiz, Juan Pablo Amelio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario; Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina
dc.description.fil
Fil: Prado, Darien Eros. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Investigaciones en Ciencias Agrarias de Rosario; Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina
dc.journal.title
SpringerPlus
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://springerplus.springeropen.com/articles/10.1186/s40064-016-2118-4
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1186/s40064-016-2118-4
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