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dc.contributor.author
Ayub, Nicolás Daniel
dc.contributor.author
Pettinari, María Julia
dc.contributor.author
Mendez, Beatriz Silvia
dc.contributor.author
López, Nancy Irene
dc.date.available
2019-04-24T18:35:31Z
dc.date.issued
2007-11
dc.identifier.citation
Ayub, Nicolás Daniel; Pettinari, María Julia; Mendez, Beatriz Silvia; López, Nancy Irene; The polyhydroxyalkanoate genes of a stress resistant Antarctic Pseudomonas are situated within a genomic island; Academic Press Inc Elsevier Science; Plasmid; 58; 3; 11-2007; 240-248
dc.identifier.issn
0147-619X
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/74940
dc.description.abstract
Pseudomonas sp. 14-3 is an Antarctic bacterium that shows high stress resistance in association with high polyhydroxybutyrate (PHB) production. In this paper genes involved in PHB biosynthesis (phaRBAC) were found within a genomic island named pha-GI. Numerous mobile elements or proteins associated with them, such as an integrase, insertion sequences, a bacterial group II intron, a complete Type I protein secretion system and IncP plasmid-related proteins were detected among the 28 ORFs identified in this large genetic element (32.3 kb). The G + C distribution was not homogeneous, likely reflecting a mosaic structure that contains regions from diverse origins. pha-GI has strong similarities with genomic islands found in diverse Proteobacteria, including Burkholderiales species and Azotobacter vinelandii. The G + C content, phylogeny inference and codon usage analysis showed that the phaBAC cluster itself has a complex mosaic structure and indicated that the phaB and phaC genes were acquired by horizontal transfer, probably derived from Burkholderiales. These results describe for the first time a pha cluster located within a genomic island, and suggest that horizontal transfer of pha genes is a mechanism of adaptability to stress conditions such as those found in the extreme Antarctic environment.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Academic Press Inc Elsevier Science
dc.rights
info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
dc.subject
Antarctica
dc.subject
Genomic Islands
dc.subject
Polyhydroxyalkanoates
dc.subject
Pseudomonas
dc.subject.classification
Otras Ciencias Biológicas
dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.title
The polyhydroxyalkanoate genes of a stress resistant Antarctic Pseudomonas are situated within a genomic island
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2019-03-27T18:06:13Z
dc.journal.volume
58
dc.journal.number
3
dc.journal.pagination
240-248
dc.journal.pais
Estados Unidos
dc.description.fil
Fil: Ayub, Nicolás Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Pettinari, María Julia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Mendez, Beatriz Silvia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina
dc.description.fil
Fil: López, Nancy Irene. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina
dc.journal.title
Plasmid
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1016/j.plasmid.2007.05.003
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0147619X07000741


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