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dc.contributor.author
Caimi, Karina Cynthia
dc.contributor.author
Romano, Maria Isabel
dc.contributor.author
Alito, Alicia
dc.contributor.author
Zumárraga, Martín José
dc.contributor.author
Bigi, Fabiana
dc.contributor.author
Cataldi, Ángel Adrián
dc.date.available
2019-03-14T21:53:18Z
dc.date.issued
2001-03
dc.identifier.citation
Caimi, Karina Cynthia; Romano, Maria Isabel; Alito, Alicia; Zumárraga, Martín José; Bigi, Fabiana; et al.; Sequence analysis of the direct repeat region in Mycobacterium bovis; American Society for Microbiology; Journal of Clinical Microbiology; 39; 3; 3-2001; 1067-1072
dc.identifier.issn
0095-1137
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/71732
dc.description.abstract
Spoligotyping is a major tool for molecular typing of Mycobacterium bovis. This technique is based on the polymorphism of spacers that separate direct repeats (DRs) in the M. tuberculosis complex DR region. Numerous M. bovis strains show a lack of several spacers which appears as a gap in the spoligotyping pattern. To determine whether these gaps contain alternative spacers not included in the spoligotyping membrane, PCRs using primers that hybridize to the spacers adjacent to the gaps were performed. Comparing the sizes of products obtained by PCR with those deduced from spoligotyping patterns, fragments were selected and sequenced to look for alternative spacers. Upon analysis of the sequences, five alternative spacers were detected, although deletions of spacers are mainly responsible for the observed gaps. The alternative spacers, which are more frequent in M. bovis than in M. tuberculosis, may contribute to increased M. bovis differentiation.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
American Society for Microbiology
dc.rights
info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Mycobacterium
dc.subject
Bovis
dc.subject.classification
Otras Ciencias Biológicas
dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.title
Sequence analysis of the direct repeat region in Mycobacterium bovis
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2019-03-14T14:21:48Z
dc.journal.volume
39
dc.journal.number
3
dc.journal.pagination
1067-1072
dc.journal.pais
Estados Unidos
dc.journal.ciudad
Washington
dc.description.fil
Fil: Caimi, Karina Cynthia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Romano, Maria Isabel. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Alito, Alicia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
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Fil: Zumárraga, Martín José. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Bigi, Fabiana. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Cataldi, Ángel Adrián. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Biotecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.journal.title
Journal of Clinical Microbiology
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1128/JCM.39.3.1067-1072.2001
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://jcm.asm.org/content/39/3/1067.long
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC87874/


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