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dc.contributor.author
Sosa, Ezequiel
dc.contributor.author
Burguener, Germán Federico
dc.contributor.author
Lanzarotti, Esteban Omar
dc.contributor.author
Defelipe, Lucas Alfredo
dc.contributor.author
Radusky, Leandro Gabriel
dc.contributor.author
Pardo, Agustin Maria
dc.contributor.author
Marti, Marcelo Adrian
dc.contributor.author
Turjanski, Adrian
dc.contributor.author
Fernández Do Porto, Darío Augusto
dc.date.available
2018-11-27T17:48:18Z
dc.date.issued
2018-01
dc.identifier.citation
Sosa, Ezequiel; Burguener, Germán Federico; Lanzarotti, Esteban Omar; Defelipe, Lucas Alfredo; Radusky, Leandro Gabriel; et al.; Target-Pathogen: A structural bioinformatic approach to prioritize drug targets in pathogens; Oxford University Press; Nucleic Acids Research; 46; D1; 1-2018; D413-D418
dc.identifier.issn
1362-4962
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/65334
dc.description.abstract
Available genomic data for pathogens has created new opportunities for drug discovery and development to fight them, including new resistant and multiresistant strains. In particular structural data must be integrated with both, gene information and experimental results. In this sense, there is a lack of an online resource that allows genome wide-based data consolidation from diverse sources together with thorough bioinformatic analysis that allows easy filtering and scoring for fast target selection for drug discovery. Here, we present Target-Pathogen database (http://target.sbg.qb.fcen.uba.ar/patho), designed and developed as an online resource that allows the integration and weighting of protein information such as: Function, metabolic role, off-targeting, structural properties including druggability, essentiality and omic experiments, to facilitate the identification and prioritization of candidate drug targets in pathogens. We include in the database 10 genomes of some of the most relevant microorganisms for human health (Mycobacterium tuberculosis, Mycobacterium leprae, Klebsiella pneumoniae, Plasmodium vivax, Toxoplasma gondii, Leishmania major, Wolbachia bancrofti, Trypanosoma brucei, Shigella dysenteriae and Schistosoma Smanosoni) and show its applicability. New genomes can be uploaded upon request.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Oxford University Press
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Mycobacterium Tuberculosis
dc.subject
Drug Design
dc.subject
Target Selection
dc.subject.classification
Otras Ciencias Biológicas
dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.title
Target-Pathogen: A structural bioinformatic approach to prioritize drug targets in pathogens
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2018-10-23T18:26:54Z
dc.journal.volume
46
dc.journal.number
D1
dc.journal.pagination
D413-D418
dc.journal.pais
Reino Unido
dc.journal.ciudad
Oxford
dc.description.fil
Fil: Sosa, Ezequiel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina
dc.description.fil
Fil: Burguener, Germán Federico. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina
dc.description.fil
Fil: Lanzarotti, Esteban Omar. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina
dc.description.fil
Fil: Defelipe, Lucas Alfredo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina
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Fil: Radusky, Leandro Gabriel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina
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Fil: Pardo, Agustin Maria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Cálculo; Argentina
dc.description.fil
Fil: Marti, Marcelo Adrian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Cálculo; Argentina
dc.description.fil
Fil: Turjanski, Adrian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Cálculo; Argentina
dc.description.fil
Fil: Fernández Do Porto, Darío Augusto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina
dc.journal.title
Nucleic Acids Research
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://academic.oup.com/nar/article/doi/10.1093/nar/gkx1015/4584621
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://dx.doi.org/10.1093/nar/gkx1015


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