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dc.contributor.author Cascales, Jimena
dc.contributor.author Bracco, Mariana
dc.contributor.author Garberoglio, Mariana J.
dc.contributor.author Poggio, Lidia
dc.contributor.author Gottlieb, Alexandra Marina
dc.date.available 2018-11-27T12:36:28Z
dc.date.issued 2017-12
dc.identifier.citation Cascales, Jimena; Bracco, Mariana; Garberoglio, Mariana J.; Poggio, Lidia; Gottlieb, Alexandra Marina; Integral phylogenomic approach over Ilex L. Species from southern South America; MDPI; Life; 7; 4; 12-2017; 1-19; 47
dc.identifier.issn 2075-1729
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/11336/65260
dc.description.abstract The use of molecular markers with inadequate variation levels has resulted in poorly resolved phylogenetic relationships within Ilex. Focusing on southern South American and Asian species, we aimed at contributing informative plastid markers. Also, we intended to gain insights into the nature of morphological and physiological characters used to identify species. We obtained the chloroplast genomes of I. paraguariensis and I. dumosa, and combined these with all the congeneric plastomes currently available to accomplish interspecific comparisons and multilocus analyses. We selected seven introns and nine IGSs as variable non-coding markers that were used in phylogenomic analyses. Eight extra IGSs were proposed as candidate markers. Southern South American species formed one lineage, except for I. paraguariensis, I. dumosa and I. argentina, which occupied intermediate positions among sampled taxa, Euroasiatic species formed two lineages. Some concordant relationships were retrieved from nuclear sequence data. We also conducted integral analyses, involving a supernetwork of molecular data, and a simultaneous analysis of quantitative and qualitative morphological and phytochemical characters, together with molecular data. The total evidence tree was used to study the evolution of non-molecular data, evidencing fifteen non-ambiguous synapomorphic character states and consolidating the relationships among southern South American species. More South American representatives should be incorporated to elucidate their origin.
dc.format application/pdf
dc.language.iso eng
dc.publisher MDPI
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject CHARACTER EVOLUTION
dc.subject MULTILOCUS PHYLOGENOMICS
dc.subject NETWORKS AND SPLITS GRAPHS
dc.subject NON-CODING REGIONS
dc.subject PLASTOMES
dc.subject SUPERNETWORK
dc.subject.classification Otras Ciencias Biológicas
dc.subject.classification Ciencias Biológicas
dc.subject.classification CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.title Integral phylogenomic approach over Ilex L. Species from southern South America
dc.type info:eu-repo/semantics/article
dc.type info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated 2018-10-23T18:33:54Z
dc.journal.volume 7
dc.journal.number 4
dc.journal.pagination 1-19; 47
dc.journal.pais Suiza
dc.journal.ciudad Basilea
dc.description.fil Fil: Cascales, Jimena. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina
dc.description.fil Fil: Bracco, Mariana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina
dc.description.fil Fil: Garberoglio, Mariana J.. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Ecología, Genética y Evolución; Argentina
dc.description.fil Fil: Poggio, Lidia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina
dc.description.fil Fil: Gottlieb, Alexandra Marina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina
dc.journal.title Life
dc.relation.alternativeid info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://www.mdpi.com/2075-1729/7/4/47
dc.relation.alternativeid info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.3390/life7040047
dc.conicet.fuente individual


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