Migrations, admixture and genetic diversity in Central Argentinian Patagonia: analysis of autosomal Alu polymorphisms

Abstract

This study aimed to analyze autosomal Alu insertions in three localities from Patagonia Argentina belonging to the Andes region and the coast of the Chubut province. Knowledge of the genetic diversity of these populations, along with the genealogical data, will contribute to better understand historical information, differential migration process and bio-demographic composition of the Central Patagonia region. In order to achieve this objective, 16 autosomal Alu insertion polymorphisms were genotyped: ACE, APO-A1, TPA25, FXIIIB, A25, HS4.32, D1, HS4.69, HS2.43, Sb19.12, Yb8NBC120, Sb19.3, Yb8NBC125, Ya5NBC221, DM, and CD4. Our results showed that the Central Patagonia region presents a complex continental genetic admixture with marked Native American roots (39% ± 1.2), Eurasian (56% ± 1.73) and, to a lesser extent, African (5% ± 1.7). The genetic proximity of the Patagonian samples in relation to groups from Europe and Northern Africa, but with a displacement towards the native communities, constitutes a clear indicator of the differential admixture process that took place in different regions of Argentina. Moreover, genetic differences were observed between Patagonian localities and Bahía Blanca (Central region of Argentina). These observations warned us that population genetic constitution analysis cannot be approached without bearing in mind the regional particularities, which are the result of the different historical, migratory, social-economic and demographic processes that occurs in the country.

Este estudio tiene como objetivo el análisis de las inserciones autosómicas Alu en tres localidades de la Patagonia argentina localizadas en la región andina y costera de la provincia de Chubut. El conocimiento de la diversidad genética de estas poblaciones, junto con los datos genealógicos, contribuirán a una mejor comprensión de la información histórica, los procesos migratorios diferenciales y la composición bio-demográfica de la región central Patagónica. Para alcanzar este objetivo se analizaron 16 polimorfismos autosómicos de inserción Alu: ACE, APO-A1, TPA25, FXIIIB, A25, HS4.32, D1, HS4.69, HS2.43, Sb19.12, Yb8NBC120, Sb19.3, Yb8NBC125, Ya5NBC221, DM y CD4. Nuestros resultados mostraron que la región central Patagónica presenta una mezcla genética continental compleja de marcadas raíces nativo americanas 39% (± 1.2), eurasiáticas 56% (± 1.73) y, en menor medida, africanas 5% (± 1.7). La proximidad genética de las muestras patagónicas a los grupos de Europa y del Norte de África, pero con un mayor desplazamiento hacia las comunidades nativas, constituye un claro indicador del proceso de mezcla diferencial que tuvo lugar en las distintas regiones de la Argentina. Por otra parte, las diferencias genéticas observadas entre las localidades de Patagonia y Bahía Blanca (región central de la Argentina), nos advierten que no puede analizarse la constitución genética de las poblaciones sin tener en cuenta las particularidades regionales, que son el resultado de los diferentes procesos históricos, migratorios, socio-económicos y demográficos que ocurrieron en el interior del país.