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dc.contributor.author
Coelho, Marcela
dc.contributor.author
Gonçalves Vidigal, María Celeste
dc.contributor.author
Souza, Lorenna Lopes de
dc.contributor.author
Nunes, María Paula Barion Alvez
dc.contributor.author
Azevedo, Rafhael Felipin
dc.contributor.author
Galván, Marta Zulema
dc.date.available
2018-09-11T20:51:13Z
dc.date.issued
2016-04
dc.identifier.citation
Coelho, Marcela; Gonçalves Vidigal, María Celeste; Souza, Lorenna Lopes de ; Nunes, María Paula Barion Alvez ; Azevedo, Rafhael Felipin; et al.; Characterization of race 65 of Colletotrichum lindemuthianum by sequencing ITS regions; Univ Estadual Maringa; Acta Scientiarum-agronomy; 38; 4; 4-2016; 429-438
dc.identifier.issn
1679-9275
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/59239
dc.description.abstract
The present work aimed characterize isolates of C. lindemuthianum race 65 from different regions in Brazil by ITS sequencing. A total of 17 isolates of race 65, collected in the states of Mato Grosso, Minas Gerais, Paraná, Santa Catarina and São Paulo, were studied. Analysis of the sequences of isolates 8, 9, 12, 14 and 15 revealed the presence of two single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the ITS1 region at the same positions. These isolates, when analyzed together with the sequence of isolate 17, revealed a SNP in the ITS2 region. The highest genetic dissimilarity, observed between isolates 11 and 3 and between isolates 11 and 10, was 0.772. In turn, isolates 7 and 2 were the most similar, with a value of 0.002 for genetic distance. The phylogenetic tree obtained based on the sequences of the ITS1 and ITS2 regions revealed the formation of two groups, one with a subgroup. The results reveal high molecular variability among isolates of race 65 of C. lindemuthianum.
dc.description.abstract
O presente trabalho teve como objetivo caracterizar isolados de C. lindemuthianum da raça 65 provenientes de diversas regiões do Brasil, por meio de sequenciamento de regiões ITS. Um total de 17 isolados da raça 65, coletados nos estados do Mato Grosso, Minas Gerais, Paraná, Santa Catarina e São Paulo, foram estudados. As análises das sequências dos isolados 8, 9, 12, 14 e 15 revelaram a presença de dois SNPs na região ITS1 nas mesmas posições. Estes mesmos isolados quando analisados juntamente com a sequência do isolado 17 apresentaram um SNP na região ITS2. A maior dissimilaridade genética foi de 0,772 observada entre os isolados 11 e 3 e entre os isolados 11 e 10. Por sua vez, os isolados 7 e 2 foram os mais similares, com valor de distância genética de 0,002. A árvore filogenética obtida com base nas sequências das regiões ITS1 e ITS2 revelou a formação de dois grupos, sendo um com a divisão de um subgrupo. Estes resultados revelam uma elevada variabilidade molecular entre isolados da raça 65 de C. lindemuthianum.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Univ Estadual Maringa
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Anthracnose
dc.subject
Genetic Variability
dc.subject
Pathohens
dc.subject
Dissimilarity
dc.subject.classification
Otras Biotecnología Agropecuaria
dc.subject.classification
Biotecnología Agropecuaria
dc.subject.classification
CIENCIAS AGRÍCOLAS
dc.title
Characterization of race 65 of Colletotrichum lindemuthianum by sequencing ITS regions
dc.title
Caracterização da raça 65 de Colletotrichum lindemuthianum utilizando sequenciamento das regiões ITS
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2018-09-04T17:56:20Z
dc.identifier.eissn
1807-8621
dc.journal.volume
38
dc.journal.number
4
dc.journal.pagination
429-438
dc.journal.pais
Brasil
dc.journal.ciudad
Maringá
dc.description.fil
Fil: Coelho, Marcela. Universidade Estadual de Maringá; Brasil
dc.description.fil
Fil: Gonçalves Vidigal, María Celeste. Universidade Estadual de Maringá; Brasil
dc.description.fil
Fil: Souza, Lorenna Lopes de. Universidade Federal de Goiás; Brasil
dc.description.fil
Fil: Nunes, María Paula Barion Alvez. Universidade Estadual de Londrina; Brasil
dc.description.fil
Fil: Azevedo, Rafhael Felipin. Universidade Estadual de Maringá; Brasil
dc.description.fil
Fil: Galván, Marta Zulema. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Salta. Estación Experimental Agropecuaria Salta; Argentina
dc.journal.title
Acta Scientiarum-agronomy
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.4025/actasciagron.v38i4.30586
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/30586


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