Mostrar el registro sencillo del ítem

dc.contributor.author
Dussaut, Julieta Sol
dc.contributor.author
Gallo, Cristian Andrés
dc.contributor.author
Cecchini, Rocío Luján
dc.contributor.author
Carballido, Jessica Andrea
dc.contributor.author
Ponzoni, Ignacio
dc.date.available
2018-09-06T21:53:09Z
dc.date.issued
2016-12
dc.identifier.citation
Dussaut, Julieta Sol; Gallo, Cristian Andrés; Cecchini, Rocío Luján; Carballido, Jessica Andrea; Ponzoni, Ignacio; Crosstalk pathway inference using topological information and biclustering of gene expression data; Elsevier; Biosystems; 150; 12-2016; 1-12
dc.identifier.issn
0303-2647
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/58647
dc.description.abstract
Detection of crosstalks among pathways is a challenging task, which requires the identification of different types of interactions associated with cellular processes. A common strategy used in bioinformatics consists in extrapolating pathway associations from the pairwise analysis of some genes related to them, using gene expression data and topological information. PET, the method proposed in this paper, goes a step further by incorporating a strategy for the detection of correlation across conditions between differentially expressed genes based on biclustering analysis. In order to evaluate the performance of this new approach, a comparison with two recently published algorithms was carried out. The methods were contrasted in the inference of pathway associations from Alzheimer disease datasets, where the new proposal presents a higher crosstalk discoveries’ rate. Finally, the analysis of the biological relevance of the pathway associations inferred by PET has shown the soundness of the extracted knowledge.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Elsevier
dc.rights
info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Alzheimer'S Disease
dc.subject
Biclustering
dc.subject
Gene Expression Analysis
dc.subject
Pathway Crosstalk
dc.subject
Topology Analysis
dc.subject.classification
Ciencias de la Computación
dc.subject.classification
Ciencias de la Computación e Información
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.title
Crosstalk pathway inference using topological information and biclustering of gene expression data
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2018-08-30T14:40:11Z
dc.journal.volume
150
dc.journal.pagination
1-12
dc.journal.pais
Países Bajos
dc.journal.ciudad
Amsterdam
dc.description.fil
Fil: Dussaut, Julieta Sol. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Instituto de Ciencias e Ingeniería de la Computación. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Ciencias e Ingeniería de la Computación. Instituto de Ciencias e Ingeniería de la Computación; Argentina
dc.description.fil
Fil: Gallo, Cristian Andrés. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Instituto de Ciencias e Ingeniería de la Computación. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Ciencias e Ingeniería de la Computación. Instituto de Ciencias e Ingeniería de la Computación; Argentina
dc.description.fil
Fil: Cecchini, Rocío Luján. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Instituto de Ciencias e Ingeniería de la Computación. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Ciencias e Ingeniería de la Computación. Instituto de Ciencias e Ingeniería de la Computación; Argentina
dc.description.fil
Fil: Carballido, Jessica Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Instituto de Ciencias e Ingeniería de la Computación. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Ciencias e Ingeniería de la Computación. Instituto de Ciencias e Ingeniería de la Computación; Argentina
dc.description.fil
Fil: Ponzoni, Ignacio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Instituto de Ciencias e Ingeniería de la Computación. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Ciencias e Ingeniería de la Computación. Instituto de Ciencias e Ingeniería de la Computación; Argentina
dc.journal.title
Biosystems
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0303264716301630
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://doi.org/10.1016/j.biosystems.2016.08.002


Archivos asociados

Documento no disponible

Comunidades y colecciones

Mostrar el registro sencillo del ítem