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dc.contributor.author
Bolatti, Elisa Maria
dc.contributor.author
Chouhy, Diego
dc.contributor.author
Casal, Pablo Roberto
dc.contributor.author
Pérez, Germán R.
dc.contributor.author
Stella, Emma Julieta
dc.contributor.author
Sanchez, Adriana
dc.contributor.author
Gorosito, Mario
dc.contributor.author
Bussy, Ramón Fernandez
dc.contributor.author
Giri, Adriana Angelica
dc.date.available
2018-07-19T17:36:27Z
dc.date.issued
2016-08
dc.identifier.citation
Bolatti, Elisa Maria; Chouhy, Diego; Casal, Pablo Roberto; Pérez, Germán R.; Stella, Emma Julieta; et al.; Characterization of novel human papillomavirus types 157, 158 and 205 from healthy skin and recombination analysis in genus γ-Papillomavirus; Elsevier Science; Infection, Genetics and Evolution; 42; 8-2016; 20-29
dc.identifier.issn
1567-1348
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/52657
dc.description.abstract
Gammapapillomavirus (γ-PV) is a diverse and rapidly expanding genus, currently consisting of 79 fully characterized human PV (HPV) types. In this study, three novel types, HPV157, HPV158 and HPV205, obtained from healthy sun-exposed skin of two immunocompetent individuals, were amplified by the "Hanging droplet" long PCR technique, cloned, sequenced and characterized. HPV157, HPV158 and HPV205 genomes comprise 7154-bp, 7192-bp and 7298-bp, respectively, and contain four early (E1, E2, E6 and E7) and two late genes (L1 and L2). Phylogenetic analysis of the L1 ORF placed all novel types within the γ-PV genus: HPV157 was classified as a new member of species γ-12 while HPV158 and HPV205 belong to species γ-1. We then explored potential recombination events in genus γ-PV with the RDP4 program in a dataset of 74 viruses (71 HPV types with available full-length genomes and the 3 novel types). Two events, both located in the E1 ORF, met the inclusion criterion (p-values <. 0.05 with at least four methods) and persisted in different ORF combinations: an inter-species recombination in species γ-8 (major and minor parents: species γ-24 and γ-11, respectively), and an intra-species recombination in species γ-7 (recombinant strain: HPV170; major and minor parents: HPV-109 and HPV-149, respectively). These findings were confirmed by phylogenetic tree incongruence analysis. An additional incongruence was found in members of species γ-9 but it was not detected by the RDP4. This report expands our knowledge of the family Papillomaviridae and provides for the first time in silico evidence of recombination in genus γ-PV.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Elsevier Science
dc.rights
info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Genus &Gamma;-Pv
dc.subject
Hpv157
dc.subject
Hpv158
dc.subject
Hpv205
dc.subject
Novel Human Papillomavirus
dc.subject
Recombination
dc.subject.classification
Otras Ciencias Biológicas
dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.title
Characterization of novel human papillomavirus types 157, 158 and 205 from healthy skin and recombination analysis in genus γ-Papillomavirus
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2018-07-18T20:44:46Z
dc.journal.volume
42
dc.journal.pagination
20-29
dc.journal.pais
Países Bajos
dc.journal.ciudad
Amsterdam
dc.description.fil
Fil: Bolatti, Elisa Maria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Chouhy, Diego. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Casal, Pablo Roberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Pérez, Germán R.. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Stella, Emma Julieta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Sanchez, Adriana. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Médicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Gorosito, Mario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Médicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Bussy, Ramón Fernandez. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Médicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Giri, Adriana Angelica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.journal.title
Infection, Genetics and Evolution
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://dx.doi.org/10.1016/j.meegid.2016.04.018
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1567134816301447


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