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dc.contributor.author
Bolatti, Elisa Maria
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dc.contributor.author
Chouhy, Diego
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dc.contributor.author
Casal, Pablo Roberto
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dc.contributor.author
Pérez, Germán R.
dc.contributor.author
Stella, Emma Julieta
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dc.contributor.author
Sanchez, Adriana
dc.contributor.author
Gorosito, Mario
dc.contributor.author
Bussy, Ramón Fernandez
dc.contributor.author
Giri, Adriana Angelica
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dc.date.available
2018-07-19T17:36:27Z
dc.date.issued
2016-08
dc.identifier.citation
Bolatti, Elisa Maria; Chouhy, Diego; Casal, Pablo Roberto; Pérez, Germán R.; Stella, Emma Julieta; et al.; Characterization of novel human papillomavirus types 157, 158 and 205 from healthy skin and recombination analysis in genus γ-Papillomavirus; Elsevier Science; Infection, Genetics and Evolution; 42; 8-2016; 20-29
dc.identifier.issn
1567-1348
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/52657
dc.description.abstract
Gammapapillomavirus (γ-PV) is a diverse and rapidly expanding genus, currently consisting of 79 fully characterized human PV (HPV) types. In this study, three novel types, HPV157, HPV158 and HPV205, obtained from healthy sun-exposed skin of two immunocompetent individuals, were amplified by the "Hanging droplet" long PCR technique, cloned, sequenced and characterized. HPV157, HPV158 and HPV205 genomes comprise 7154-bp, 7192-bp and 7298-bp, respectively, and contain four early (E1, E2, E6 and E7) and two late genes (L1 and L2). Phylogenetic analysis of the L1 ORF placed all novel types within the γ-PV genus: HPV157 was classified as a new member of species γ-12 while HPV158 and HPV205 belong to species γ-1. We then explored potential recombination events in genus γ-PV with the RDP4 program in a dataset of 74 viruses (71 HPV types with available full-length genomes and the 3 novel types). Two events, both located in the E1 ORF, met the inclusion criterion (p-values <. 0.05 with at least four methods) and persisted in different ORF combinations: an inter-species recombination in species γ-8 (major and minor parents: species γ-24 and γ-11, respectively), and an intra-species recombination in species γ-7 (recombinant strain: HPV170; major and minor parents: HPV-109 and HPV-149, respectively). These findings were confirmed by phylogenetic tree incongruence analysis. An additional incongruence was found in members of species γ-9 but it was not detected by the RDP4. This report expands our knowledge of the family Papillomaviridae and provides for the first time in silico evidence of recombination in genus γ-PV.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Elsevier Science
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Genus Γ-Pv
dc.subject
Hpv157
dc.subject
Hpv158
dc.subject
Hpv205
dc.subject
Novel Human Papillomavirus
dc.subject
Recombination
dc.subject.classification
Otras Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
Characterization of novel human papillomavirus types 157, 158 and 205 from healthy skin and recombination analysis in genus γ-Papillomavirus
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2018-07-18T20:44:46Z
dc.journal.volume
42
dc.journal.pagination
20-29
dc.journal.pais
Países Bajos
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dc.journal.ciudad
Amsterdam
dc.description.fil
Fil: Bolatti, Elisa Maria. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Chouhy, Diego. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Casal, Pablo Roberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Pérez, Germán R.. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Stella, Emma Julieta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Sanchez, Adriana. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Médicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Gorosito, Mario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Médicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Bussy, Ramón Fernandez. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Médicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Giri, Adriana Angelica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.journal.title
Infection, Genetics and Evolution
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://dx.doi.org/10.1016/j.meegid.2016.04.018
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1567134816301447
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