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dc.contributor.author Sookoian, Silvia Cristina
dc.contributor.author Flichman, Diego Martin
dc.contributor.author Scian, Romina
dc.contributor.author Rohr, Cristian Oscar
dc.contributor.author Dopazo, Hernán Javier
dc.contributor.author Fernández Gianotti, Tomás
dc.contributor.author San Martino, Julio
dc.contributor.author Castaño, Gustavo Osvaldo
dc.contributor.author Pirola, Carlos José
dc.date.available 2018-06-05T13:28:11Z
dc.date.issued 2016-12
dc.identifier.citation Sookoian, Silvia Cristina; Flichman, Diego Martin; Scian, Romina; Rohr, Cristian Oscar; Dopazo, Hernán Javier; et al.; Mitochondrial genome architecture in non-alcoholic fatty liver disease; John Wiley & Sons Ltd; Journal of Pathology; 240; 4; 12-2016; 437-449
dc.identifier.issn 0022-3417
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/11336/47275
dc.description.abstract Non‐alcoholic fatty liver disease (NAFLD) is associated with mitochondrial dysfunction, a decreased liver mitochondrial DNA (mtDNA) content, and impaired energy metabolism. To understand the clinical implications of mtDNA diversity in the biology of NAFLD, we applied deep‐coverage whole sequencing of the liver mitochondrial genomes. We used a multistage study design, including a discovery phase, a phenotype‐oriented study to assess the mutational burden in patients with steatohepatitis at different stages of liver fibrosis, and a replication study to validate findings in loci of interest. We also assessed the potential protein‐level impact of the observed mutations. To determine whether the observed changes are tissue‐specific, we compared the liver and the corresponding peripheral blood entire mitochondrial genomes. The nuclear genes POLG and POLG2 (mitochondrial DNA polymerase‐γ) were also sequenced. We observed that the liver mtDNA of patients with NAFLD harbours complex genomes with a significantly higher mutational (1.28‐fold) rate and degree of heteroplasmy than in controls. The analysis of liver mitochondrial genomes of patients with different degrees of fibrosis revealed that the disease severity is associated with an overall 1.4‐fold increase in mutation rate, including mutations in genes of the oxidative phosphorylation (OXPHOS) chain. Significant differences in gene and protein expression patterns were observed in association with the cumulative number of OXPHOS polymorphic sites. We observed a high degree of homology (∼98%) between the blood and liver mitochondrial genomes. A missense POLG p.Gln1236His variant was associated with liver mtDNA copy number. In conclusion, we have demonstrated that OXPHOS genes contain the highest number of hotspot positions associated with a more severe phenotype. The variability of the mitochondrial genomes probably originates from a common germline source; hence, it may explain a fraction of the ‘missing heritability’ of NAFLD.
dc.format application/pdf
dc.language.iso eng
dc.publisher John Wiley & Sons Ltd
dc.rights info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights.uri https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject MITOCHONDRIAL GENOME
dc.subject NGS
dc.subject NAFLD
dc.subject GENOMICS
dc.subject.classification Inmunología
dc.subject.classification Medicina Básica
dc.subject.classification CIENCIAS MÉDICAS Y DE LA SALUD
dc.title Mitochondrial genome architecture in non-alcoholic fatty liver disease
dc.type info:eu-repo/semantics/article
dc.type info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated 2018-06-04T17:03:42Z
dc.journal.volume 240
dc.journal.number 4
dc.journal.pagination 437-449
dc.journal.pais Reino Unido
dc.journal.ciudad Londres
dc.description.fil Fil: Sookoian, Silvia Cristina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Médicas. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; Argentina
dc.description.fil Fil: Flichman, Diego Martin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica; Argentina
dc.description.fil Fil: Scian, Romina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Médicas. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; Argentina
dc.description.fil Fil: Rohr, Cristian Oscar. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina
dc.description.fil Fil: Dopazo, Hernán Javier. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Ecología, Genética y Evolución de Buenos Aires; Argentina
dc.description.fil Fil: Fernández Gianotti, Tomás. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Médicas. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; Argentina
dc.description.fil Fil: San Martino, Julio. Hospital Diego Thompson; Argentina
dc.description.fil Fil: Castaño, Gustavo Osvaldo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital "Dr. Abel Zubizarreta"; Argentina
dc.description.fil Fil: Pirola, Carlos José. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones Médicas. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones Médicas; Argentina
dc.journal.title Journal of Pathology
dc.relation.alternativeid info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://doi.org/10.1002/path.4803
dc.relation.alternativeid info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/path.4803
dc.conicet.fuente unificacion


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