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dc.contributor.author
Ferragut, Fatima Eneida del Valle
dc.contributor.author
Vega, Celina Guadalupe
dc.contributor.author
Mauroy, Axel
dc.contributor.author
Conceição Neto, Nádia
dc.contributor.author
Zeller, Mark
dc.contributor.author
Heylen, Elisabeth
dc.contributor.author
Louge Uriarte, Enrique Leopoldo
dc.contributor.author
Bilbao, Gladys Noemí
dc.contributor.author
Bok, Marina
dc.contributor.author
Matthijnssens, Jelle
dc.contributor.author
Thiry, Etienne
dc.contributor.author
Badaracco, Alejandra
dc.contributor.author
Parreño, Gladys Viviana
dc.date.available
2018-05-21T22:47:26Z
dc.date.issued
2016-06
dc.identifier.citation
Ferragut, Fatima Eneida del Valle; Vega, Celina Guadalupe; Mauroy, Axel; Conceição Neto, Nádia; Zeller, Mark; et al.; Molecular detection of bovine Noroviruses in Argentinean dairy calves: Circulation of a tentative new genotype; Elsevier Science; Infection, Genetics and Evolution; 40; 6-2016; 144-150
dc.identifier.issn
1567-1348
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/45851
dc.description.abstract
Bovine noroviruses are enteric pathogens detected in fecal samples of both diarrheic and non-diarrheic calves from several countries worldwide. However, epidemiological information regarding bovine noroviruses is still lacking for many important cattle producing countries from South America. In this study, three bovine norovirus genogroup III sequences were determined by conventional RT-PCR and Sanger sequencing in feces from diarrheic dairy calves from Argentina (B4836, B4848, and B4881, all collected in 2012). Phylogenetic studies based on a partial coding region for the RNA-dependent RNA polymerase (RdRp, 503 nucleotides) of these three samples suggested that two of them (B4836 and B4881) belong to genotype 2 (GIII.2) while the third one (B4848) was more closely related to genotype 1 (GIII.1) strains. By deep sequencing, the capsid region from two of these strains could be determined. This confirmed the circulation of genotype 1 (B4848) together with the presence of another sequence (B4881) sharing its highest genetic relatedness with genotype 1, but sufficiently distant to constitute a new genotype. This latter strain was shown in silico to be a recombinant: phylogenetic divergence was detected between its RNA-dependent RNA polymerase coding sequence (genotype GIII.2) and its capsid protein coding sequence (genotype GIII.1 or a potential norovirus genotype). According to this data, this strain could be the second genotype GIII.2_GIII.1 bovine norovirus recombinant described in literature worldwide. Further analysis suggested that this strain could even be a potential norovirus GIII genotype, tentatively named GIII.4. The data provides important epidemiological and evolutionary information on bovine noroviruses circulating in South America.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Elsevier Science
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Argentina
dc.subject
Bovine
dc.subject
Diarrhea
dc.subject
Genotype
dc.subject
Norovirus
dc.subject
Recombination
dc.subject.classification
Otras Producción Animal y Lechería
dc.subject.classification
Producción Animal y Lechería
dc.subject.classification
CIENCIAS AGRÍCOLAS
dc.title
Molecular detection of bovine Noroviruses in Argentinean dairy calves: Circulation of a tentative new genotype
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2018-05-11T20:40:30Z
dc.journal.volume
40
dc.journal.pagination
144-150
dc.journal.pais
Países Bajos
dc.journal.ciudad
Amsterdam
dc.description.fil
Fil: Ferragut, Fatima Eneida del Valle. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Virología; Argentina
dc.description.fil
Fil: Vega, Celina Guadalupe. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Virología; Argentina
dc.description.fil
Fil: Mauroy, Axel. Université de Liège; Bélgica
dc.description.fil
Fil: Conceição Neto, Nádia. Katholikie Universiteit Leuven; Bélgica
dc.description.fil
Fil: Zeller, Mark. Katholikie Universiteit Leuven; Bélgica
dc.description.fil
Fil: Heylen, Elisabeth. Katholikie Universiteit Leuven; Bélgica
dc.description.fil
Fil: Louge Uriarte, Enrique Leopoldo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Área de Investigación en Producción y Sanidad Animal; Argentina
dc.description.fil
Fil: Bilbao, Gladys Noemí. Universidad Nacional del Centro de la Provincia de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Veterinarias; Argentina
dc.description.fil
Fil: Bok, Marina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Virología; Argentina
dc.description.fil
Fil: Matthijnssens, Jelle. Katholikie Universiteit Leuven; Bélgica
dc.description.fil
Fil: Thiry, Etienne. Université de Liège; Bélgica
dc.description.fil
Fil: Badaracco, Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Virología; Argentina
dc.description.fil
Fil: Parreño, Gladys Viviana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Virología; Argentina
dc.journal.title
Infection, Genetics and Evolution
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S156713481630065X
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1016/j.meegid.2016.02.034
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