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dc.contributor.author
Berruezo, Florencia
dc.contributor.author
Silva Junqueira de Souza, Flavio
dc.contributor.author
Picca, Pablo Ignacio
dc.contributor.author
Nemirovsky, Sergio Ivan
dc.contributor.author
Martínez Tosar, Leandro Julián
dc.contributor.author
Rivero, Mercedes
dc.contributor.author
Mentaberry, Alejandro Nestor
dc.contributor.author
Zelada, Alicia Mercedes
dc.date.available
2018-05-07T17:01:21Z
dc.date.issued
2017-05
dc.identifier.citation
Berruezo, Florencia; Silva Junqueira de Souza, Flavio; Picca, Pablo Ignacio; Nemirovsky, Sergio Ivan; Martínez Tosar, Leandro Julián; et al.; Sequencing of small RNAs of the fern Pleopeltis minima (Polypodiaceae) offers insight into the evolution of the microrna repertoire in land plants; Public Library of Science; Plos One; 12; 5; 5-2017; 1-22; e0177573
dc.identifier.issn
1932-6203
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/44301
dc.description.abstract
MicroRNAs (miRNAs) are short, single stranded RNA molecules that regulate the stability and translation of messenger RNAs in diverse eukaryotic groups. Several miRNA genes are of ancient origin and have been maintained in the genomes of animal and plant taxa for hundreds of millions of years, playing key roles in development and physiology. In the last decade, genome and small RNA (sRNA) sequencing of several plant species have helped unveil the evolutionary history of land plants. Among these, the fern group (monilophytes) occupies a key phylogenetic position, as it represents the closest extant cousin taxon of seed plants, i.e. gymno-and angiosperms. However, in spite of their evolutionary, economic and ecological importance, no fern genome has been sequenced yet and few genomic resources are available for this group. Here, we sequenced the small RNA fraction of an epiphytic South American fern, Pleopeltis minima (Polypodiaceae), and compared it to plant miRNA databases, allowing for the identification of miRNA families that are shared by all land plants, shared by all vascular plants (tracheophytes) or shared by euphyllophytes (ferns and seed plants) only. Using the recently described transcriptome of another fern, Lygodium japonicum, we also estimated the degree of conservation of fern miRNA targets in relation to other plant groups. Our results pinpoint the origin of several miRNA families in the land plant evolutionary tree with more precision and are a resource for future genomic and functional studies of fern miRNAs.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Public Library of Science
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Microrna
dc.subject
Evolution
dc.subject
Plants
dc.subject
Ferns
dc.subject.classification
Otras Ciencias Biológicas
dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.title
Sequencing of small RNAs of the fern Pleopeltis minima (Polypodiaceae) offers insight into the evolution of the microrna repertoire in land plants
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2018-05-03T21:05:31Z
dc.journal.volume
12
dc.journal.number
5
dc.journal.pagination
1-22; e0177573
dc.journal.pais
Estados Unidos
dc.journal.ciudad
San Francisco
dc.description.fil
Fil: Berruezo, Florencia. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Silva Junqueira de Souza, Flavio. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Fisiología, Biología Molecular y Celular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina
dc.description.fil
Fil: Picca, Pablo Ignacio. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Biodiversidad y Biología Experimental; Argentina
dc.description.fil
Fil: Nemirovsky, Sergio Ivan. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Martínez Tosar, Leandro Julián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Biodiversidad y Biología Experimental y Aplicada. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Biodiversidad y Biología Experimental y Aplicada; Argentina
dc.description.fil
Fil: Rivero, Mercedes. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Rosario. Instituto de Agrobiotecnología de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Mentaberry, Alejandro Nestor. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Biodiversidad y Biología Experimental y Aplicada. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Biodiversidad y Biología Experimental y Aplicada; Argentina
dc.description.fil
Fil: Zelada, Alicia Mercedes. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Biodiversidad y Biología Experimental y Aplicada. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Instituto de Biodiversidad y Biología Experimental y Aplicada; Argentina
dc.journal.title
Plos One
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0177573
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0177573


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