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dc.contributor.author Tosso, Rodrigo David
dc.contributor.author Andújar, Sebastián Antonio
dc.contributor.author Gutierrez, Lucas Joel
dc.contributor.author Angelina, Emilio Luis
dc.contributor.author Rodriguez, Ricaurte
dc.contributor.author Nogueras, Manuel
dc.contributor.author Baldoni, Hector Armando
dc.contributor.author Suvire, Fernando Daniel
dc.contributor.author Cobos, Justo
dc.contributor.author Enriz, Ricardo Daniel
dc.date.available 2016-02-23T15:08:18Z
dc.date.issued 2013-06
dc.identifier.citation Tosso, Rodrigo David; Andújar, Sebastián Antonio; Gutierrez, Lucas Joel; Angelina, Emilio Luis; Rodriguez, Ricaurte; et al.; Molecular Modeling Study of Dihydrofolate Reductase Inhibitors. Molecular Dynamics Simulations, Quantum Mechanical Calculations, and Experimental Corroboration; American Chemical Society; Journal of Chemical Information and Modeling; 53; 8; 6-2013; 2018-2032
dc.identifier.issn 1549-9596
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/11336/4381
dc.description.abstract A molecular modeling study on dihydrofolate reductase (DHFR) inhibitors was carried out. By combining molecular dynamics simulations with semiempirical (PM6), ab initio, and density functional theory (DFT) calculations, a simple and generally applicable procedure to evaluate the binding energies of DHFR inhibitors interacting with the human enzyme is reported here, providing a clear picture of the binding interactions of these ligands from both structural and energetic viewpoints. A reduced model for the binding pocket was used. This approach allows us to perform more accurate quantum mechanical calculations as well as to obtain a detailed electronic analysis using the quantum theory of atoms in molecules (QTAIM) technique. Thus, molecular aspects of the binding interactions between inhibitors and the DHFR are discussed in detail. A significant correlation between binding energies obtained from DFT calculations and experimental IC50 values was obtained, predicting with an acceptable qualitative accuracy the potential inhibitor effect of nonsynthesized compounds. Such correlation was experimentally corroborated synthesizing and testing two new inhibitors reported in this paper.
dc.format application/pdf
dc.language.iso eng
dc.publisher American Chemical Society
dc.rights info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights.uri https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject Dihydrofolate reductase
dc.subject Molecular modelling
dc.subject Non classic inhibitors
dc.subject QTAIM
dc.subject.classification Bioquímica y Biología Molecular
dc.subject.classification Ciencias Biológicas
dc.subject.classification CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.title Molecular Modeling Study of Dihydrofolate Reductase Inhibitors. Molecular Dynamics Simulations, Quantum Mechanical Calculations, and Experimental Corroboration
dc.type info:eu-repo/semantics/article
dc.type info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated 2016-03-30 10:35:44.97925-03
dc.journal.volume 53
dc.journal.number 8
dc.journal.pagination 2018-2032
dc.journal.pais Estados Unidos
dc.journal.ciudad Washington
dc.description.fil Fil: Tosso, Rodrigo David. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico San Luis. Instituto Multidisciplinario de Investigación Biológica de San Luis; Argentina. Universidad Nacional de San Luis. Facultad de Quimica, Bioquimica y Farmacia. Departamento de Quimica Analitica; Argentina
dc.description.fil Fil: Andújar, Sebastián Antonio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico San Luis. Instituto Multidisciplinario de Investigación Biológica de San Luis; Argentina. Universidad Nacional de San Luis. Facultad de Quimica, Bioquimica y Farmacia. Departamento de Quimica; Argentina
dc.description.fil Fil: Gutierrez, Lucas Joel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico San Luis. Instituto Multidisciplinario de Investigación Biológica de San Luis; Argentina. Universidad Nacional de San Luis. Facultad de Quimica, Bioquimica y Farmacia. Departamento de Quimica; Argentina
dc.description.fil Fil: Angelina, Emilio Luis. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico San Luis. Instituto Multidisciplinario de Investigación Biológica de San Luis; Argentina. Universidad Nacional del Nordeste. Facultad de Cs.exactas Naturales y Agrimensura. Departamento de Quimica. Laboratorio de Estructura Molecular y Propiedades; Argentina
dc.description.fil Fil: Rodriguez, Ricaurte. Universidad Nacional de Colombia. Departamento de Química; Colombia
dc.description.fil Fil: Nogueras, Manuel. Universidad de Jaén. Departamento de Química Inorgánica y Orgánica; España
dc.description.fil Fil: Baldoni, Hector Armando. Universidad Nacional de San Luis. Facultad de Quimica, Bioquimica y Farmacia. Departamento de Quimica Analitica; Argentina
dc.description.fil Fil: Suvire, Fernando Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico San Luis. Instituto Multidisciplinario de Investigación Biológica de San Luis; Argentina. Universidad Nacional de San Luis. Facultad de Quimica, Bioquimica y Farmacia. Departamento de Quimica; Argentina
dc.description.fil Fil: Cobos, Justo. Universidad de Jaén. Departamento de Química Inorgánica y Orgánica; España
dc.description.fil Fil: Enriz, Ricardo Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico San Luis. Instituto Multidisciplinario de Investigación Biológica de San Luis; Argentina. Universidad Nacional de San Luis. Facultad de Quimica, Bioquimica y Farmacia. Departamento de Quimica; Argentina
dc.journal.title Journal of Chemical Information and Modeling
dc.relation.alternativeid info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ci400178h
dc.relation.alternativeid info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/DOI:10.1021/ci400178h
dc.relation.alternativeid info:eu-repo/semantics/altIdentifier/issn/1549-9596


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