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dc.contributor.author
Pierdominici Sottile, Gustavo
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dc.contributor.author
Cossio Pérez, Rodrigo
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dc.contributor.author
Galindo Cruz, Johan Fabian
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dc.contributor.author
Palma, Juliana Isabel
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dc.date.available
2018-01-26T19:01:00Z
dc.date.issued
2014-10
dc.identifier.citation
Pierdominici Sottile, Gustavo; Cossio Pérez, Rodrigo; Galindo Cruz, Johan Fabian; Palma, Juliana Isabel; QM/MM Molecular Dynamics Study of the Galactopyranose → Galactofuranose Reaction Catalysed by Trypanosoma cruzi UDP-Galactopyranose Mutase; Public Library of Science; Plos One; 9; 10; 10-2014; 1-12; e109559
dc.identifier.issn
1932-6203
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/34739
dc.description.abstract
The enzyme UDP-Galactopyranose Mutase (UGM) catalyses the conversion of galactopyranose into galactofuranose. It is known to be critical for the survival and proliferation of several pathogenic agents, both prokaryotic and eukaryotic. Among them is Trypanosoma cruzi, the parasite responsible for Chagas' disease. Since the enzyme is not present in mammals, it appears as a promising target for the design of drugs to treat this illness. A precise knowledge of the mechanism of the catalysed reaction would be crucial to assist in such design. In this article we present a detailed study of all the putative steps of the mechanism. The study is based on QM/MM free energy calculations along properly selected reaction coordinates, and on the analysis of the main structural changes and interactions taking place at every step. The results are discussed in connection with the experimental evidence and previous theoretical studies.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Public Library of Science
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
dc.subject
Udp Galactopyranose Mutase
dc.subject
Molecular Dynamics
dc.subject
Umbrella Sampling
dc.subject.classification
Otras Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.subject.classification
Otras Ciencias Químicas
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dc.subject.classification
Ciencias Químicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
QM/MM Molecular Dynamics Study of the Galactopyranose → Galactofuranose Reaction Catalysed by Trypanosoma cruzi UDP-Galactopyranose Mutase
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2018-01-24T18:58:11Z
dc.journal.volume
9
dc.journal.number
10
dc.journal.pagination
1-12; e109559
dc.journal.pais
Estados Unidos
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dc.journal.ciudad
San Francisco
dc.description.fil
Fil: Pierdominici Sottile, Gustavo. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Cossio Pérez, Rodrigo. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Galindo Cruz, Johan Fabian. Universidad Nacional de Colombia; Colombia
dc.description.fil
Fil: Palma, Juliana Isabel. Universidad Nacional de Quilmes. Departamento de Ciencia y Tecnología; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.journal.title
Plos One
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0109559
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0109559
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4192007/
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