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dc.contributor.author Fernandez, María Elena
dc.contributor.author Goszczynski, Daniel Estanislao
dc.contributor.author Liron, Juan Pedro
dc.contributor.author Villegas Castagnasso, Egle Etel
dc.contributor.author Carino, Mónica Herminia
dc.contributor.author Ripoli, María Verónica
dc.contributor.author Rogberg Muñoz, Andres
dc.contributor.author Posik, Diego Manuel
dc.contributor.author Peral Garcia, Pilar
dc.contributor.author Giovambattista, Guillermo
dc.date.available 2015-11-16T15:41:15Z
dc.date.issued 2013-06
dc.identifier.citation Fernandez, María Elena; Goszczynski, Daniel Estanislao; Liron, Juan Pedro; Villegas Castagnasso, Egle Etel; Carino, Mónica Herminia; et al.; Comparison of the effectiveness of microsatellites and SNP panels for genetic identification, traceability and assessment of parentage in an inbred Angus herd; Sociedade Brasileira de Genética; Genetics and Molecular Biology; 36; 2; 6-2013; 185-191
dc.identifier.issn 1415-4757
dc.identifier.uri http://hdl.handle.net/11336/2819
dc.description.abstract During the last decade, microsatellites (short tandem repeats or STRs) have been successfully used for animal genetic identification, traceability and paternity, although in recent year single nucleotide polymorphisms (SNPs) have been increasingly used for this purpose. An efficient SNP identification system requires a marker set with enough power to identify individuals and their parents. Genetic diagnostics generally include the analysis of related animals. In this work, the degree of information provided by SNPs for a consanguineous herd of cattle was compared with that provided by STRs. Thirty-six closely related Angus cattle were genotyped for 18 STRs and 116 SNPs. Cumulative SNPs exclusion power values (Q) for paternity and sample matching probability (MP) yielded values greater than 0.9998 and 4.32E-42, respectively. Generally 2-3 SNPs per STR were needed to obtain an equivalent Q value. The MP showed that 24 SNPs were equivalent to the ISAG (International Society for Animal Genetics) minimal recommended set of 12 STRs (MP ~ 10-11). These results provide valuable genetic data that support the consensus SNP panel for bovine genetic identification developed by the Parentage Recording Working Group of ICAR (International Committee for Animal Recording).
dc.format application/pdf
dc.language.iso eng
dc.publisher Sociedade Brasileira de Genética
dc.rights info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri https://creativecommons.org/licenses/by-nc/2.5/ar/
dc.subject MICROSATELLITE
dc.subject SINGLE NUCLEOTIDE POLYMORPHISM
dc.subject EXCLUSION PROBABILITY
dc.subject GENETIC IDENTIFICATION
dc.subject BOVINE
dc.subject.classification Genética y Herencia
dc.subject.classification Ciencias Biológicas
dc.subject.classification CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.subject.classification Ciencias Veterinarias
dc.subject.classification Ciencias Veterinarias
dc.subject.classification CIENCIAS AGRÍCOLAS
dc.title Comparison of the effectiveness of microsatellites and SNP panels for genetic identification, traceability and assessment of parentage in an inbred Angus herd
dc.type info:eu-repo/semantics/article
dc.type info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated 2016-03-30 10:35:44.97925-03
dc.identifier.eissn 1678-4685
dc.journal.volume 36
dc.journal.number 2
dc.journal.pagination 185-191
dc.journal.pais Bra
dc.journal.ciudad San Pablo
dc.description.fil Fil: Fernandez, María Elena. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ingeniero Fernando Noel Dulout"; Argentina
dc.description.fil Fil: Goszczynski, Daniel Estanislao. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ingeniero Fernando Noel Dulout"; Argentina
dc.description.fil Fil: Liron, Juan Pedro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ingeniero Fernando Noel Dulout"; Argentina
dc.description.fil Fil: Villegas Castagnasso, Egle Etel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ingeniero Fernando Noel Dulout"; Argentina
dc.description.fil Fil: Carino, Mónica Herminia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ingeniero Fernando Noel Dulout"; Argentina. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas; Argentina
dc.description.fil Fil: Ripoli, María Verónica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ingeniero Fernando Noel Dulout"; Argentina
dc.description.fil Fil: Rogberg Muñoz, Andres. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ingeniero Fernando Noel Dulout"; Argentina
dc.description.fil Fil: Posik, Diego Manuel. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ingeniero Fernando Noel Dulout"; Argentina
dc.description.fil Fil: Peral Garcia, Pilar. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ingeniero Fernando Noel Dulout"; Argentina
dc.description.fil Fil: Giovambattista, Guillermo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ingeniero Fernando Noel Dulout"; Argentina
dc.journal.title Genetics and Molecular Biology
dc.relation.alternativeid info:eu-repo/semantics/altIdentifier/issn/1415-4757
dc.relation.alternativeid info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1590/S1415-47572013000200008
dc.relation.alternativeid info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572013000200008&lng=en&nrm=iso&tlng=en
dc.relation.alternativeid info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3715284/
dc.relation.alternativeid info:eu-repo/semantics/altIdentifier/issn/1678-4685


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