Análisis genómico del locus MAT en Trichoderma koningiopsis: implicancias en la capacidad reproductiva sexual

Abstract

Trichoderma es un género de hongos filamentosos con creciente interés biotecnológico debido a su uso como agente de biocontrol, productor de enzimas y promotor del crecimiento vegetal. Aunque muchas especies son consideradas asexuales, se han identificado formas sexuales en especies relacionadas clasificadas en el género Hypocrea, lo que sugiere la posible existencia de genes sexuales en Trichoderma. El locus MAT, responsable de la determinación del tipo sexual en hongos ascomicetes, ha sido poco explorado en especies como Trichoderma koningiopsis. En este estudio se investigó su presencia mediante análisis genómicos in silico, utilizando datos de secuenciación generados por tecnología Illumina a partir de una cepa fúngica nativa de interés biotecnológico. Se buscaron genes del locus MAT (MAT1-1-1, MAT1-2-1, MAT1-1-2, MAT1-1-3) y genes flanqueantes (SLA2 y APN2). La detección de estos genes permitiría inferir capacidad reproductiva sexual latente, con posibles aplicaciones en el mejoramiento genético. Sin embargo, no se detectó la presencia de los genes MAT, lo que sugiere que T. koningiopsis es probablemente una especie exclusivamente asexual. En consecuencia, futuras estrategias de mejoramiento genético deberán basarse en métodos alternativos como ingeniería genética, mutagénesis o selección de variantes naturales.

Trichoderma is a genus of filamentous fungi with increasing biotechnological relevance due to its applications as a biocontrol agent, enzyme producer, and plant growth promoter. Although many Trichoderma species are considered asexual, the discovery of sexual forms in closely related species within the genus Hypocrea suggests the potential presence of sexual reproduction genes. Among them, the MAT (mating-type) locus plays a key role in determining sexual identity in ascomycetous fungi. However, its presence remains unexplored in species such as Trichoderma koningiopsis. In this study, we conducted an in silico genomic analysis to investigate the presence of MAT locus genes in T. koningiopsis, using Illumina-generated sequencing data from native fungal strain of biotechnological interest. We searched for MAT1-1-1, MAT1-2-1, MAT1-1-2, MAT1-1-3, as well as the flanking genes SLA2 and APN2. The absence of MAT genes in our dataset suggests that T. koningiopsis is likely an obligate asexual species. This finding has direct implications for genetic improvement strategies, which should focus on alternative approaches such as mutagenesis, genetic engineering, or selection of naturally occurring variants.