Mostrar el registro sencillo del ítem
dc.contributor.author
Bruno, Augusto
dc.contributor.author
Bruno, Luciana
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.contributor.author
Levi, Valeria
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.date.available
2015-11-12T14:12:25Z
dc.date.issued
2013-01
dc.identifier.citation
Bruno, Augusto; Bruno, Luciana; Levi, Valeria; Extracting the stepping dynamics of molecular motors in living cells from trajectories of single particles; Springer; Cell Biochemistry and Biophysics; 65; 1; 1-2013; 1-11
dc.identifier.issn
1085-9195
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/2745
dc.description.abstract
Molecular motors are responsible of transporting a wide variety of cargos in the cytoplasm. Current efforts are oriented to characterize the biophysical properties of motors in cells with the aim of elucidating the mechanisms of these nanomachines in the complex cellular environment. In this work, we present an algorithm designed to extract motor step sizes and dwell times between steps from trajectories of motors or cargoes driven by motors in cells. The algorithm is based on finding patterns in the trajectory compatible with the behavior expected for a motor step i.e., a region of confined motion followed by a jump in the position to another region of confined motion with similar characteristics to the previous one. We show that this algorithm allows the analysis of 2D trajectories even if they present complex motion patterns such as active transport interspersed with diffusion and does not require the assumption of a given step size or dwell period. The confidence on the step detection can be easily obtained and allows the evaluation of the confidence of the dwell and step size distributions. To illustrate the possible applications of this algorithm, we analyzed trajectories of myosin-V driven organelles in living cells.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Springer
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
DWELL TIME
dc.subject
MOLECULAR MOTORS
dc.subject
SINGLE PARTICLE TRACKING
dc.subject
STEPPING DYNAMICS
dc.subject
XENOPUS MELANOPHORES
dc.subject.classification
Biología Celular, Microbiología
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.subject.classification
Biofísica
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.title
Extracting the stepping dynamics of molecular motors in living cells from trajectories of single particles
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2016-03-30 10:35:44.97925-03
dc.identifier.eissn
1559-0283
dc.journal.volume
65
dc.journal.number
1
dc.journal.pagination
1-11
dc.journal.pais
Alemania
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.journal.ciudad
Berlin
dc.description.fil
Fil: Bruno, Augusto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Física; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina
dc.description.fil
Fil: Bruno, Luciana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Física de Buenos Aires; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Física; Argentina
dc.description.fil
Fil: Levi, Valeria. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Química Biológica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Ciudad Universitaria. Instituto de Química Biológica de la Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina
dc.journal.title
Cell Biochemistry and Biophysics
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://link.springer.com/article/10.1007%2Fs12013-012-9397-3
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1007/s12013-012-9397-3
Archivos asociados