Resultados del modelado molecular de oxitetraciclina y lincomicina

Abstract

El objetivo general de este trabajo es evaluar la susceptibilidad de dos antibióticos muy usados en el campo veterinario: oxitetraciclina y lincomicina, frente a la degradación por plasma, utilizando herramientas de modelado computacional. En particular, se buscó estimar los tiempos relativos de degradación de los antibióticos de acuerdo a su potencial de ionización, e identificar los sitios que, debido a su densidad electrónica y disposición espacial, posean mayor probabilidad de ser atacados por radicales libres. Se emplearon los softwares HyperChem y Gaussian 09W para la búsqueda conformacional, optimización de geometrías y cálculo de los índices condensados de Fukui. La búsqueda conformacional se realizó en primer lugar, con métodos de mecánica molecular (MM+), luego, con AM1 (método semiempírico). Las geometrías se optimizaron con la teoría del funcional de la densidad (DFT), con funciones B3LYP/6-311G(d,p). En todos los casos, se verificó que las estructuras halladas correspondan a mínimos de energía verificando que todas las frecuencias sean positivas. Los efectos del solvente se consideraron utilizando el modelo SMD (Solvent Model Density). En este contexto, se adjuntan los archivos correspondientes a las estructuras optimizadas de los conformeros obtenidos en un rango de 6 kcal/mol.