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dc.contributor.author
Figueiró, Henrique V.
dc.contributor.author
Li, Gang
dc.contributor.author
Trindade, Fernanda J.
dc.contributor.author
Assis, Juliana
dc.contributor.author
Pais, Fabiano
dc.contributor.author
Fernandes, Gabriel
dc.contributor.author
Santos, Sarah H. D.
dc.contributor.author
Hughes, Graham M.
dc.contributor.author
Komissarov, Aleksey
dc.contributor.author
Antunes, Agostinho
dc.contributor.author
Trinca, Cristine S.
dc.contributor.author
Rodrigues, Maíra R.
dc.contributor.author
Linderoth, Tyler
dc.contributor.author
Bi, Ke
dc.contributor.author
Silveira, Leandro
dc.contributor.author
Azevedo, Fernando C. C.
dc.contributor.author
Kantek, Daniel
dc.contributor.author
Ramalho, Emiliano
dc.contributor.author
Brassaloti, Ricardo A.
dc.contributor.author
Villela, Priscilla M. S.
dc.contributor.author
Nunes, Adauto L. V.
dc.contributor.author
Teixeira, Rodrigo H. F.
dc.contributor.author
Morato, Ronaldo G.
dc.contributor.author
Loska, Damian
dc.contributor.author
Saragueta, Patricia Esther
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dc.contributor.author
Gabaldón, Toni
dc.contributor.author
Teeling, Emma C.
dc.contributor.author
O'Brien, Stephen J.
dc.contributor.author
Nielsen, Rasmus
dc.contributor.author
Coutinho, Luiz L.
dc.contributor.author
Oliveira, Guilherme C.
dc.contributor.author
Murphy, William J.
dc.contributor.author
Eizirik, Eduardo
dc.date.available
2017-09-19T15:20:06Z
dc.date.issued
2017-06-19
dc.identifier.citation
Figueiró, Henrique V.; Li, Gang; Trindade, Fernanda J.; Assis, Juliana; Pais, Fabiano; et al.; Genome-wide signatures of complex introgression and adaptive evolution in the big cats; American Association for the Advancement of Science; Science Advances; 3; 7; 19-6-2017; e1700299-e1700299
dc.identifier.issn
2375-2548
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/24569
dc.description.abstract
The great cats of genus Panthera are amongst the most iconic animals in the world, capturing historical human fascination and present concern regarding their imperilled status in the wild. The five extant species derive from a recent radiation, which has posed difficulties to the resolution of their phylogeny, while offering opportunities to understand the adaptive divergence of closely related and widely successful top predators. Here we report the sequence, de novo assembly and annotation of the jaguar (Panthera onca) genome, and comparative analyses with all other Panthera species, including novel genomic data from the leopard. We observed pervasive genealogical discordance across the Panthera genomes, caused by both incomplete lineage sorting and complex patterns of historical interspecific hybridization. Introgressed genomic segments include loci bearing signatures of selective sweeps, suggesting that post-speciation admixture facilitated the evolutionary rescue of lineages affected by small and/or unstable effective population sizes. We used site-based models and genome-wide timetree scans to identify signatures of positive selection in the Panthera genomes, affecting genes involved in brain, skull and limb development, body size, sensory perception, pigmentation and behaviour. These findings reveal the complex history of the Panthera radiation and several genes that may underlie its current phenotypic diversity.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
American Association for the Advancement of Science
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Genomica
dc.subject
Jaguar
dc.subject
Evolution
dc.subject
Panthera Onca
dc.subject.classification
Bioquímica y Biología Molecular
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.subject.classification
Conservación de la Biodiversidad
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
Genome-wide signatures of complex introgression and adaptive evolution in the big cats
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2017-09-08T20:19:46Z
dc.identifier.eissn
2375-2548
dc.journal.volume
3
dc.journal.number
7
dc.journal.pagination
e1700299-e1700299
dc.journal.pais
Estados Unidos
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dc.journal.ciudad
Washington
dc.description.fil
Fil: Figueiró, Henrique V.. Pontificia Universidade Catolica Do Rio Grande Do Sul; Brasil
dc.description.fil
Fil: Li, Gang. Texas A&M University; Estados Unidos
dc.description.fil
Fil: Trindade, Fernanda J.. Pontificia Universidade Catolica Do Rio Grande Do Sul; Brasil
dc.description.fil
Fil: Assis, Juliana. Centro de Pesquisa Rene Rachou; Brasil
dc.description.fil
Fil: Pais, Fabiano. Centro de Pesquisa Rene Rachou; Brasil
dc.description.fil
Fil: Fernandes, Gabriel. Centro de Pesquisa Rene Rachou; Brasil
dc.description.fil
Fil: Santos, Sarah H. D.. Pontificia Universidade Catolica Do Rio Grande Do Sul; Brasil
dc.description.fil
Fil: Hughes, Graham M.. Universidad de Dublin; Irlanda
dc.description.fil
Fil: Komissarov, Aleksey. Saint Petersburg State University; Rusia
dc.description.fil
Fil: Antunes, Agostinho. Universidade Do Porto; Portugal
dc.description.fil
Fil: Trinca, Cristine S.. Pontificia Universidade Catolica Do Rio Grande Do Sul; Brasil
dc.description.fil
Fil: Rodrigues, Maíra R.. Pontificia Universidade Catolica Do Rio Grande Do Sul; Brasil
dc.description.fil
Fil: Linderoth, Tyler. University of California; Estados Unidos
dc.description.fil
Fil: Bi, Ke. University of California; Estados Unidos
dc.description.fil
Fil: Silveira, Leandro. Instituto Onça-pintada; Brasil
dc.description.fil
Fil: Azevedo, Fernando C. C.. Universidade Federal de São João del Rey; Brasil. Instituto Pró-Carnívoros; Brasil
dc.description.fil
Fil: Kantek, Daniel. Pontificia Universidade Catolica Do Rio Grande Do Sul; Brasil. Instituto Pró-Carnívoros; Brasil
dc.description.fil
Fil: Ramalho, Emiliano. Instituto Pró-Carnívoros; Brasil. Instituto de Desenvolvimento Sustentável Mamirauá; Brasil
dc.description.fil
Fil: Brassaloti, Ricardo A.. Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz; Brasil
dc.description.fil
Fil: Villela, Priscilla M. S.. Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz; Brasil
dc.description.fil
Fil: Nunes, Adauto L. V.. Zoológico Municipal de Sorocaba; Brasil
dc.description.fil
Fil: Teixeira, Rodrigo H. F.. Zoológico Municipal de Sorocaba; Brasil. Universidade Estadual Paulista Botucatu; Brasil
dc.description.fil
Fil: Morato, Ronaldo G.. Instituto Pró-Carnívoros; Brasil. Instituto Chico Mendes de Conservação da Biodiversidade; Brasil
dc.description.fil
Fil: Loska, Damian. Centro de Regulación Genómica; España. Universitat Pompeu Fabra; España
dc.description.fil
Fil: Saragueta, Patricia Esther. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Biología y Medicina Experimental. Fundación de Instituto de Biología y Medicina Experimental. Instituto de Biología y Medicina Experimental; Argentina
dc.description.fil
Fil: Gabaldón, Toni. Centro de Regulación Genómica; España. Universitat Pompeu Fabra; España. Institució Catalana de Recerca i Estudis Avancats; España
dc.description.fil
Fil: Teeling, Emma C.. Universidad de Dublin; Irlanda
dc.description.fil
Fil: O'Brien, Stephen J.. Saint Petersburg State University; Rusia
dc.description.fil
Fil: Nielsen, Rasmus. University of California; Estados Unidos
dc.description.fil
Fil: Coutinho, Luiz L.. Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz; Brasil
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Fil: Oliveira, Guilherme C.. Centro de Pesquisa René Rachou; Brasil
dc.description.fil
Fil: Murphy, William J.. Texas A&M University; Estados Unidos
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Fil: Eizirik, Eduardo. Pontificia Universidade Catolica Do Rio Grande Do Sul; Brasil. Instituto Pró-Carnívoros; Brasil
dc.journal.title
Science Advances
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://advances.sciencemag.org/content/3/7/e1700299
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1126/sciadv.1700299
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info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5517113/
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/pmid/28776029
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