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dc.contributor.author
Soto, Gabriela Cynthia
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dc.contributor.author
Alleva, Karina Edith
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dc.contributor.author
Amodeo, Gabriela
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dc.contributor.author
Muschietti, Jorge Prometeo
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dc.contributor.author
Ayub, Nicolás Daniel
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dc.date.available
2024-08-28T10:30:26Z
dc.date.issued
2012-05
dc.identifier.citation
Soto, Gabriela Cynthia; Alleva, Karina Edith; Amodeo, Gabriela; Muschietti, Jorge Prometeo; Ayub, Nicolás Daniel; New insight into the evolution of aquaporins from flowering plants and vertebrates: Orthologous identification and functional transfer is possible; Elsevier Science; Gene; 503; 1; 5-2012; 165-176
dc.identifier.issn
0378-1119
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/243222
dc.description.abstract
Aquaporins (AQPs) represent a family of channel proteins that transport water and/or small solutes across cell membranes in the three domains of life. In all previous phylogenetic analysis of aquaporin, trees constructed using proteins with very low amino acid identity (b15%) were incongruent with rRNA data. In this work, restricting the evolutionary study of aquaporins to proteins with high amino acid identity (>25%), we showed congruence between AQPs and organismal trees. On the basis of this analysis, we defined 19 orthologous gene clusters in flowering plant species (3 PIP-like, 7 TIP-like, 6 NIP-like and 3 SIP-like). We described specific conserved motifs for each subfamily and each cluster, which were used to develop a method for automatic classification. Analysis of amino acid identity between orthologous monocotyledon and dicotyledon AQPs from each cluster, suggested that PIPs are under high evolutionary constraint. The phylogenetic analysis allowed us the assignment of orthologous aquaporins for very distant animal lineages (tetrapodsfishes). We also demonstrated that the location of all vertebrate AQPs in the ortholog clusters could be predicted by comparing their amino acid identity with human AQPs. We defined four AQP subfamilies in animals: AQP1- like, AQP8-like, AQP3-like and AQP11-like. Phylogenetic analysis showed that the four animal AQPs subfamilies are related with PIP-like, TIP-like, NIP-like and SIP-like subfamilies, respectively. Thus, this analysis would allow the prediction of individual AQPs function on the basis of orthologous genes from Arabidopsis thaliana and Homo sapiens.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Elsevier Science
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
aquaporin
dc.subject
evolution
dc.subject
gene transfer
dc.subject
orthologs
dc.subject.classification
Ciencias de las Plantas, Botánica
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
New insight into the evolution of aquaporins from flowering plants and vertebrates: Orthologous identification and functional transfer is possible
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2024-08-28T10:03:58Z
dc.journal.volume
503
dc.journal.number
1
dc.journal.pagination
165-176
dc.journal.pais
Países Bajos
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dc.journal.ciudad
Amsterdam
dc.description.fil
Fil: Soto, Gabriela Cynthia. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Genética; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina
dc.description.fil
Fil: Alleva, Karina Edith. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Biodiversidad y Biología Experimental; Argentina
dc.description.fil
Fil: Amodeo, Gabriela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Biodiversidad y Biología Experimental; Argentina
dc.description.fil
Fil: Muschietti, Jorge Prometeo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Instituto de Investigaciones en Ingeniería Genética y Biología Molecular "Dr. Héctor N. Torres"; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Departamento de Biodiversidad y Biología Experimental; Argentina
dc.description.fil
Fil: Ayub, Nicolás Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación en Ciencias Veterinarias y Agronómicas. Instituto de Genética; Argentina
dc.journal.title
Gene
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0378111912004349
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1016/j.gene.2012.04.021
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