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dc.contributor.author
Vallejo, Diego Fernando Gustavo
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dc.contributor.author
Grigera, Jose Raul
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dc.contributor.author
Costabel, Marcelo Daniel
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dc.date.available
2024-08-06T10:11:15Z
dc.date.issued
2008-12
dc.identifier.citation
Vallejo, Diego Fernando Gustavo; Grigera, Jose Raul; Costabel, Marcelo Daniel; A hydrophobic loop in acyl-CoA binding protein is functionally important for binding to palmitoyl-coenzyme A: A molecular dynamics study; Elsevier Science; International Journal of Biological Macromolecules; 42; 3; 12-2008; 271-277
dc.identifier.issn
0141-8130
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/241788
dc.description.abstract
Acyl-CoA binding protein (ACBP) plays a key role in lipid metabolism, interacting via a partly unknown mechanism with high affinity with long chain fatty acyl-CoAs (LCFA-CoAs). At present there is no study of the microscopic way ligand binding is accomplished. We analyzed this process by molecular dynamics (MDs) simulations. We proposed a computational model of ligand, able to reproduce some evidence from nuclear magnetic resonance (NMR) data, quantitative time resolved fluorometry and X-ray crystallography. We found that a hydrophobic loop, not in the active site, is important for function. Besides, multiple sequence alignment shows hydrophobicity (and not the residues itselves) conservation.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Elsevier Science
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Acyl-coenzyme A binding protein;
dc.subject
Molecular dynamics
dc.subject
Long chain fatty acyl-coenzyme A;
dc.subject.classification
Otras Ciencias Naturales y Exactas
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dc.subject.classification
Otras Ciencias Naturales y Exactas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
A hydrophobic loop in acyl-CoA binding protein is functionally important for binding to palmitoyl-coenzyme A: A molecular dynamics study
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2024-08-05T13:43:22Z
dc.journal.volume
42
dc.journal.number
3
dc.journal.pagination
271-277
dc.journal.pais
Países Bajos
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dc.journal.ciudad
Amsterdam
dc.description.fil
Fil: Vallejo, Diego Fernando Gustavo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Física de Líquidos y Sistemas Biológicos. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Física de Líquidos y Sistemas Biológicos; Argentina
dc.description.fil
Fil: Grigera, Jose Raul. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Física de Líquidos y Sistemas Biológicos. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Instituto de Física de Líquidos y Sistemas Biológicos; Argentina
dc.description.fil
Fil: Costabel, Marcelo Daniel. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Física; Argentina
dc.journal.title
International Journal of Biological Macromolecules
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0141813007002991
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1016/j.ijbiomac.2007.12.003
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