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dc.date.available
2024-06-12T18:42:29Z
dc.identifier.citation
Baricalla, Agustin Ariel; Carrere Gómez, Manuela; Federico, Maria Laura; (2024): Sorghum bicolor: Polimorfismos (SNPs e InDel) de los genotipos SS79 y M71 y sus impactos estimados. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. (dataset). http://hdl.handle.net/11336/237987
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/237987
dc.description.abstract
Identificación de SNPs e Indels en el genotipo de sorgo dulce SS79 y el granífero M71 (Shiringani et al, 2010; Shiringani y Friedt, 2011), re-secuenciados en un Illumina Novaseq 6000, utilizando la herramienta SNIPPY4.6 (Seemann, 2015). El genoma utilizado como referencia fue BTx623 v.3.1.1. El impacto funcional de los polimorfismos se evaluó utilizando SNPeff v.4.3 (Cingolani et al., 2012). SNPs and Indels identified in the sweet sorghum genotype SS79 and grain sorghum M71 (Shiringani et al, 2010; Shiringani and Friedt, 2011), re-sequenced on an Illumina Novaseq 6000, using SNIPPY4.6 (Seemann, 2015). The reference genome used was BTx623 v.3.1.1. The functional impact of SNPs and Indels was evaluated using SNPeff v.4.3 (Cingolani et al., 2012).
dc.rights
info:eu-repo/semantics/embargoedAccess
dc.rights.uri
https://opendatacommons.org/licenses/by/1-0/
dc.title
Sorghum bicolor: Polimorfismos (SNPs e InDel) de los genotipos SS79 y M71 y sus impactos estimados
dc.type
dataset
dc.date.updated
2024-06-07T11:22:13Z
dc.description.fil
Fil: Baricalla, Agustin Ariel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones y Transferencia del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires. Universidad Nacional del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigaciones y Transferencia del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires; Argentina
dc.description.fil
Fil: Carrere Gómez, Manuela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones y Transferencia del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires. Universidad Nacional del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigaciones y Transferencia del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires; Argentina
dc.description.fil
Fil: Federico, Maria Laura. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.rights.embargoDate
2025-03-03
dc.datacite.PublicationYear
2024
dc.datacite.Creator
Baricalla, Agustin Ariel
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dc.datacite.Creator
Carrere Gómez, Manuela
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dc.datacite.Creator
Federico, Maria Laura
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dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones y Transferencia del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires. Universidad Nacional del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigaciones y Transferencia del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires
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dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro de Investigaciones y Transferencia del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires. Universidad Nacional del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires. Centro de Investigaciones y Transferencia del Noroeste de la Provincia de Buenos Aires
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dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
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dc.datacite.publisher
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
dc.datacite.subject
Biotecnología Agrícola y Biotecnología Alimentaria
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dc.datacite.subject
Biotecnología Agropecuaria
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dc.datacite.subject
CIENCIAS AGRÍCOLAS
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dc.datacite.date
21/06/2021
dc.datacite.DateType
Creado
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dc.datacite.language
eng
dc.datacite.version
1.0
dc.relationtype.isSourceOf
https://ri.conicet.gov.ar/handle/11336/237918
dc.relationtype.isSourceOf
https://ri.conicet.gov.ar/handle/11336/237920
dc.relationtype.isSourceOf
https://ri.conicet.gov.ar/handle/11336/237921
dc.subject.keyword
SNP
dc.subject.keyword
InDel
dc.subject.keyword
SS79
dc.subject.keyword
M71
dc.datacite.resourceTypeGeneral
dataset
dc.conicet.datoinvestigacionid
16593
dc.conicet.justificacion
Se trata de un archivo resultante de la utilización de una herramienta bioinformática.
dc.datacite.formatedDate
2021
Archivos del conjunto de datos
Archivo
Notas de uso
Tamaño
SS79.zip
Embargado hasta 03-03-2025
59.97Mb
M71.zip
Embargado hasta 03-03-2025
57.42Mb