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dc.date.available
2024-05-10T12:00:59Z
dc.identifier.citation
Castañeda, María Teresita; Nuñez, Sebastián; Jamilis Ricaldoni, Martín Ignacio; de Battista, Hernán; (2024): Small-scale metabolic model for lipid production in Rhodosporidium toruloides iTC116. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. (dataset). http://hdl.handle.net/11336/235072
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/235072
dc.description.abstract
This dataset presents the small-scale metabolic model for lipid production by Rhodosporidium toruloides iTC116. The model comprises 93 metabolites, 104 metabolic reactions, and 116 genes, representing key metabolic pathways involved in biomass and lipid production within the extracellular medium, cytosol, and mitochondria compartment. It includes the assimilation of four substrates (glucose, glycerol, xylose, and arabinose), commonly used in biotechnological industries as sole or combined carbon and energy sources. The model also delineates the primary pathways for metabolic precursor, energy, and reducing power, including glycolysis, the pentose phosphate pathway, the tricarboxylic acid cycle, central nitrogen metabolism, oxidative phosphorylation, and the glyoxylate cycle. This resource is designed for use with the COBRA Toolbox for MATLAB and includes a metabolic map for visualizing flux distribution with the Escher pathway map visualization tool.
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.title
Small-scale metabolic model for lipid production in Rhodosporidium toruloides iTC116
dc.type
dataset
dc.date.updated
2024-05-10T11:14:42Z
dc.description.fil
Fil: Castañeda, María Teresita. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones en Electrónica, Control y Procesamiento de Señales. Universidad Nacional de La Plata. Instituto de Investigaciones en Electrónica, Control y Procesamiento de Señales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Nuñez, Sebastián. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones en Electrónica, Control y Procesamiento de Señales. Universidad Nacional de La Plata. Instituto de Investigaciones en Electrónica, Control y Procesamiento de Señales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Jamilis Ricaldoni, Martín Ignacio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones en Electrónica, Control y Procesamiento de Señales. Universidad Nacional de La Plata. Instituto de Investigaciones en Electrónica, Control y Procesamiento de Señales; Argentina
dc.description.fil
Fil: de Battista, Hernán. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones en Electrónica, Control y Procesamiento de Señales. Universidad Nacional de La Plata. Instituto de Investigaciones en Electrónica, Control y Procesamiento de Señales; Argentina
dc.datacite.PublicationYear
2024
dc.datacite.Creator
Castañeda, María Teresita
dc.datacite.Creator
Nuñez, Sebastián
dc.datacite.Creator
Jamilis Ricaldoni, Martín Ignacio
dc.datacite.Creator
de Battista, Hernán
dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones en Electrónica, Control y Procesamiento de Señales. Universidad Nacional de La Plata. Instituto de Investigaciones en Electrónica, Control y Procesamiento de Señales
dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones en Electrónica, Control y Procesamiento de Señales. Universidad Nacional de La Plata. Instituto de Investigaciones en Electrónica, Control y Procesamiento de Señales
dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones en Electrónica, Control y Procesamiento de Señales. Universidad Nacional de La Plata. Instituto de Investigaciones en Electrónica, Control y Procesamiento de Señales
dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto de Investigaciones en Electrónica, Control y Procesamiento de Señales. Universidad Nacional de La Plata. Instituto de Investigaciones en Electrónica, Control y Procesamiento de Señales
dc.datacite.publisher
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
dc.datacite.subject
Bioproductos, Biomateriales, Bioplásticos, Biocombustibles, Bioderivados, etc.
dc.datacite.subject
Biotecnología Industrial
dc.datacite.subject
INGENIERÍAS Y TECNOLOGÍAS
dc.datacite.subject
Biotecnología Industrial
dc.datacite.subject
Biotecnología Industrial
dc.datacite.subject
INGENIERÍAS Y TECNOLOGÍAS
dc.datacite.date
2024
dc.datacite.DateType
Creado
dc.datacite.language
eng
dc.datacite.version
1.0
dc.datacite.FundingReference
PICT 2014-2394
dc.datacite.FundingReference
PICT 2017-3211
dc.datacite.FundingReference
PICT 2019-3635
dc.datacite.FundingReference
PIP 11220200100331CO
dc.datacite.FunderName
Ministerio de Ciencia. Tecnología e Innovación Productiva. Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica
dc.datacite.FunderName
Ministerio de Ciencia. Tecnología e Innovación Productiva. Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica
dc.datacite.FunderName
Ministerio de Ciencia. Tecnología e Innovación Productiva. Agencia Nacional de Promoción Científica y Tecnológica
dc.datacite.FunderName
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales
dc.relationtype.isSourceOf
https://ri.conicet.gov.ar/handle/11336/85459
dc.relationtype.isSourceOf
https://ri.conicet.gov.ar/handle/11336/122723
dc.relationtype.isSourceOf
http://dx.doi.org/10.1002/bit.28579
dc.subject.keyword
RHODOSPORIDIUM TORULOIDES
dc.subject.keyword
METABOLIC MODEL
dc.subject.keyword
LIPID PRODUCTION
dc.subject.keyword
METABOLIC ENGINEERING
dc.datacite.resourceTypeGeneral
dataset
dc.conicet.datoinvestigacionid
15594
dc.datacite.awardTitle
Conmutación e invariancia de sistemas dinámicos. Aplicación al control, optimización y monitoreo de procesos y sistemas biológicos
dc.datacite.awardTitle
Métodos y algoritmos de control conmutado con aplicaciones en ingeniería de bioprocesos e ingeniería biomédica
dc.datacite.awardTitle
Empleo de herramientas de ingeniería metabólica para la optimización de la producción de biocombustibles de tercera generación
dc.datacite.awardTitle
Optimización y control para el aprovechamiento de energías renovables
dc.conicet.justificacion
Es válido para cualquier localización geográfica.
dc.datacite.formatedDate
2024
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