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dc.contributor.author
Steeman, Tomás José
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dc.contributor.author
Weiner, Andrea Maria Julia
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dc.contributor.author
David, Aldana Paula
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dc.contributor.author
Binolfi, Andrés
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Calcaterra, Nora Beatriz
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dc.contributor.author
Armas, Pablo
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dc.date.available
2024-04-22T10:58:19Z
dc.date.issued
2023-03
dc.identifier.citation
Steeman, Tomás José; Weiner, Andrea Maria Julia; David, Aldana Paula; Binolfi, Andrés; Calcaterra, Nora Beatriz; et al.; G-Quadruplexes Regulate miRNA Biogenesis in Live Zebrafish Embryos; Molecular Diversity Preservation International; International Journal of Molecular Sciences; 24; 5; 3-2023; 1-16
dc.identifier.issn
1661-6596
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/233656
dc.description.abstract
RNA guanine quadruplexes (G4s) regulate RNA functions, metabolism, and processing. G4s formed within precursors of microRNAs (pre-miRNAs) may impair pre-miRNAs maturation by Dicer, thus repressing mature miRNA biogenesis. As miRNAs are essential for proper embryonic development, we studied the role of G4s on miRNA biogenesis in vivo during zebrafish embryogenesis. We performed a computational analysis on zebrafish pre-miRNAs to find putative G4 forming sequences (PQSs). The precursor of the miRNA 150 (pre-miR-150) was found to contain an evolutionarily conserved PQS formed by three G-tetrads and able to fold in vitro as G4. MiR-150 controls the expression of myb, which shows a well-defined knock-down phenotype in zebrafish developing embryos. We microinjected zebrafish embryos with in vitro transcribed pre-miR-150 synthesized using either GTP (G-pre-miR-150) or 7-Deaza-GTP, a GTP analogue unable to form G4s (7DG-pre-miR-150). Compared to embryos injected with G-pre-miR-150, embryos injected with 7DG-pre-miR-150 showed higher levels of miRNA 150 (miR-150) and lower levels of myb mRNA and stronger phenotypes associated with myb knock-down. The incubation of pre-miR-150 prior to the injection with the G4 stabilizing ligand pyridostatin (PDS) reverted gene expression variations and rescued the phenotypes related to myb knock-down. Overall, results suggest that the G4 formed in pre-miR-150 functions in vivo as a conserved regulatory structure competing with the stem-loop structure necessary for miRNA biogenesis.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Molecular Diversity Preservation International
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
dc.subject
EMBRYONIC DEVELOPMENT
dc.subject
G-QUADRUPLEX
dc.subject
MICRORNA
dc.subject
MIR-150
dc.subject
ZEBRAFISH
dc.subject.classification
Bioquímica y Biología Molecular
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
G-Quadruplexes Regulate miRNA Biogenesis in Live Zebrafish Embryos
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2024-04-19T12:17:49Z
dc.identifier.eissn
1422-0067
dc.journal.volume
24
dc.journal.number
5
dc.journal.pagination
1-16
dc.journal.pais
Suiza
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dc.journal.ciudad
Basel
dc.description.fil
Fil: Steeman, Tomás José. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Weiner, Andrea Maria Julia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: David, Aldana Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Binolfi, Andrés. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Calcaterra, Nora Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Armas, Pablo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Rosario. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario. Universidad Nacional de Rosario. Facultad de Ciencias Bioquímicas y Farmacéuticas. Instituto de Biología Molecular y Celular de Rosario; Argentina
dc.journal.title
International Journal of Molecular Sciences
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.mdpi.com/1422-0067/24/5/4828
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.3390/ijms24054828
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