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dc.contributor.author
Elena, Alan
dc.contributor.author
Cejas, Daniela
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dc.contributor.author
Gutkind, Gabriel Osvaldo
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dc.contributor.author
Radice, Marcela Alejandra
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dc.date.available
2024-03-25T11:49:38Z
dc.date.issued
2024-03
dc.identifier.citation
Elena, Alan; Cejas, Daniela; Gutkind, Gabriel Osvaldo; Radice, Marcela Alejandra; Genomic characterization of blaVIM-11-harbouring plasmids recovered from Pseudomonas aeruginosa; Elsevier; Journal of Global Antimicrobial Resistance; 36; 3-2024; 190-192
dc.identifier.issn
2213-7165
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/231398
dc.description.abstract
Objectives: To the best of our knowledge, no genomic descriptions of blaVIM-11-harbouring plasmids are available in literature so far. The aim of this study was to describe the genomic features of three blaVIM-11-harbouring plasmids recovered from Pseudomonas aeruginosa isolated in Argentina in different periods. Methods: blaVIM-11-harbouring plasmids from three clinical P. aeruginosa isolates were transferred by transformation into P. aeruginosa PAO-1. Then, genomic DNA of these transformants was extracted and sequenced using NovaSeq 6000 System-Illumina. De novo assemblies were generated using Unicycler program and reads were mapped against a reference genome of P. aeruginosa PAO-1. Plasmids sequences were predicted identifying the reads that did not map the reference sequence of PAO-1. These reads were recovered and assembled de novo. In silico predictions were carried out using bioinformatics tools. Results: One Plasmid (pP6VIM-11) was distributed in 2 contigs, a second plasmid (pPOta2VIM-11) was found in a single contig, and the last one (pP936401VIM-11) was fragmented into 4 contigs. pP6VIM-11 and pPOta2VIM-11 belonged to the IncP-1β group, displaying 64% of coverage and 83.9% of identity among them. pP936401VIM-1 plasmid corresponded to the IncN group. The bioinformatic analysis revealed that blaVIM-11 was located in a class 1 integron, flanked by insertion sequences, exhibiting potential for its dissemination. However, none of the plasmids were conjugative. Conclusion: This study corresponded to the first description and deposit of blaVIM-11-harbouring plasmids in P. aeruginosa, which expands the limited knowledge about their molecular epidemiology.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Elsevier
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
dc.subject
ARGENTINA
dc.subject
INCN
dc.subject
INCP1
dc.subject
PLASMIDS
dc.subject
PSEUDOMONAS AERUGINOSA
dc.subject
VIM-11
dc.subject.classification
Biología Celular, Microbiología
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
Genomic characterization of blaVIM-11-harbouring plasmids recovered from Pseudomonas aeruginosa
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2024-03-19T14:27:14Z
dc.identifier.eissn
2213-7173
dc.journal.volume
36
dc.journal.pagination
190-192
dc.journal.pais
Países Bajos
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dc.journal.ciudad
Amsterdam
dc.description.fil
Fil: Elena, Alan. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Investigaciones en Bacteriología y Virología Molecular; Argentina. Technische Universität Dresden; Alemania. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina
dc.description.fil
Fil: Cejas, Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Investigaciones en Bacteriología y Virología Molecular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Gutkind, Gabriel Osvaldo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Investigaciones en Bacteriología y Virología Molecular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Radice, Marcela Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Houssay; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquímica. Instituto de Investigaciones en Bacteriología y Virología Molecular; Argentina
dc.journal.title
Journal of Global Antimicrobial Resistance
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1016/j.jgar.2023.12.014
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2213716523002242
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