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dc.contributor.author
Ceriotti, Luis Federico
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dc.contributor.author
Roulet, Maria Emilia
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dc.contributor.author
Garcia, Laura Evangelina
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dc.contributor.author
Sánchez Puerta, María Virginia
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dc.date.available
2024-03-22T11:14:15Z
dc.date.issued
2019
dc.identifier.citation
Genetic code change in at-rich plastid genomes of two holoperasitic plants (balanophoraceae); XVII Congreso Latinoamericano de Genética; XLVII Congreso Argentino de Genética; LII Reunión Anual de la Sociedad de Genética de Chile; VI Congreso de la Sociedad Uruguaya de Genética; V Congreso Latinoamericano de Genética Humana; V Simposio Latinoamericano de Citogenética y Evolución; Mendoza; Argentina; 2019; 279-279
dc.identifier.issn
1852-6322
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/231263
dc.description.abstract
The family Balanophoraceae (order Santalales) encompasses 14 genera of obligate root holoparasites (i.e. completely nonphotosynthetic and host-dependent plants). As in other nonphotosynthetic angiosperms, plastid genomes (ptDNA) in Balanophora spp. are characterized by a high degree of reduction in size and gene content, and low levels of GC content. In addition, a novel type of genetic-code change was discovered, in which the TAG codon codes for tryptophan instead of being a stop-codon. In this study, we sequenced and analyzed ptDNA regions of Lophophytum mirabile and Ombrophytum subterraneum (Balanophoraceae). Total DNA from both species was sequenced with Illumina technology. Also, RNAseq was performed for L. mirabile. The ptDNA assembly was carried out based on genomic and transcriptomic paired-end reads. Plastid contigs of L. mirabile and O. subterraneum had an average AT content of 79.55% and 81.75%, respectively. Ribosomal and protein coding genes showed high substitution rates, as in other members of the family. We identified a different change in the genetic code of both ptDNAs; in this case TGA (typically a stop codon) codes for tryptophan. It represents the second case of a genetic-code change in land-plant ptDNAs. RNA editing was not found in the sequenced plastid genes.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Sociedad Argentina de Genética
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
HOLOPARASITE
dc.subject
GENETIC CODE
dc.subject
PLASTID
dc.subject
GENOME
dc.subject.classification
Ciencias de las Plantas, Botánica
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
Genetic code change in at-rich plastid genomes of two holoperasitic plants (balanophoraceae)
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type
info:eu-repo/semantics/conferenceObject
dc.type
info:ar-repo/semantics/documento de conferencia
dc.date.updated
2023-03-09T23:34:02Z
dc.journal.volume
30
dc.journal.number
1 Suppl.
dc.journal.pagination
279-279
dc.journal.pais
Argentina
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dc.journal.ciudad
Ciudad Autónoma de Buenos Aires
dc.description.fil
Fil: Ceriotti, Luis Federico. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Roulet, Maria Emilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina
dc.description.fil
Fil: Garcia, Laura Evangelina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina
dc.description.fil
Fil: Sánchez Puerta, María Virginia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias. Instituto de Biología Agrícola de Mendoza; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Exactas y Naturales; Argentina. Universidad Nacional de Cuyo. Facultad de Ciencias Agrarias; Argentina
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://sag.org.ar/jbag/wp-content/uploads/2019/09/V.XXX_2019_Suppl.1_Web.pdf
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.35407/bag.2019.XXX.01.supp
dc.conicet.rol
Autor
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dc.coverage
Internacional
dc.type.subtype
Congreso
dc.description.nombreEvento
XVII Congreso Latinoamericano de Genética; XLVII Congreso Argentino de Genética; LII Reunión Anual de la Sociedad de Genética de Chile; VI Congreso de la Sociedad Uruguaya de Genética; V Congreso Latinoamericano de Genética Humana; V Simposio Latinoamericano de Citogenética y Evolución
dc.date.evento
2019-10-06
dc.description.ciudadEvento
Mendoza
dc.description.paisEvento
Argentina
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dc.type.publicacion
Journal
dc.description.institucionOrganizadora
Asociacion Latinoamericana de Genética
dc.description.institucionOrganizadora
Asociación Argentina de Genética
dc.description.institucionOrganizadora
Sociedad de Genética de Chile
dc.description.institucionOrganizadora
Sociedad Uruguaya de Genética
dc.description.institucionOrganizadora
Red Latinoamericana de Genética Humana
dc.description.institucionOrganizadora
V Slace
dc.source.revista
Revista de la Sociedad Argentina de Genética
dc.date.eventoHasta
2019-10-09
dc.type
Congreso
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