ADN repetitivo en Solanum betaceum Cav. (Solanaceae)

Abstract

El tomate de árbol (Solanaceas) es originario de la region andina de America del Sur. Es popular para su consumo en jugos y como fruta fresca, constituyendo un complemento de nutrientes necesarios en la dieta. Posee 2n=24 cromosomas y un tamano genomico grande. En Argentina, accesos de esta especie presentan diferencias fenotipicas. Para comprender y caracterizar la fraccion repetitiva del genoma, secuenciamos el ADN de cinco poblaciones utilizando baja cobertura (0,1×). Realizamos un analisis de agrupamiento, ensamblamos los genomas de cloroplastos y ADN ribosomales y localizamos las repeticiones mas abundantes mediante FISH. Observamos que todos los accesos tienen un tamano genomico similar (21,58-23,60 pg) y que la fraccion repetitiva constituye el 75% del genoma, siendo el retrotransposon Ty3/gypsy-Tekay (45%) es el mas abundante. Ademas, identificamos cuatro familias distintas de ADN satelite, que conforman el 0,7% de la fraccion repetitiva. Aunque los elementos repetitivos son compartidos por todos los accesos, la abundancia relativa de cada familia y de los ADN ribosomales varia. Los genomas plastidiales, a diferencia del nuclear, son altamente conservados (99%). Esto concuerda con estudios previos en otras especies de Solanaceae, donde se observo una acumulacion de secuencias de ADN repetitivas, especialmente retrotransposones. Nuestros resultados confirman que este genoma es altamente dinamico en su fraccion repetitiva, pero conservado en sus genomas plastidiales.