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Cepeda, Paula Julieta
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Racca, María Emilia
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Rossetti, María Florencia
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dc.contributor.author
Cardozo, M. Alejandra
dc.contributor.author
Gaydou, Luisa
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dc.contributor.author
Luque, Enrique Hugo
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dc.contributor.author
Muñoz-de-Toro, Mónica
dc.contributor.author
Milesi, Maria Mercedes
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dc.contributor.author
Varayoud, Jorgelina Guadalupe
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dc.contributor.author
Ramos, Jorge Guillermo
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dc.date.available
2024-02-07T15:26:22Z
dc.date.issued
2023-12
dc.identifier.citation
Cepeda, Paula Julieta; Racca, María Emilia; Rossetti, María Florencia; Cardozo, M. Alejandra; Gaydou, Luisa; et al.; A Reliable Method for Quantifying Plasma Cell-Free DNA Using an Internal Standard Strategy: Evaluation in a Cohort of Non-Pregnant and Pregnant Women; SAGE Publications; Reproductive Sciences; 12-2023; 1-10
dc.identifier.issn
1933-7191
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/226167
dc.description.abstract
The use of plasma cell-free DNA (cfDNA) as a useful biomarker in obstetric clinical practice has been delayed due to the lack of reliable quantification protocols. We developed a protocol to quantify plasma cfDNA using an internal standard strategy to overcome difficulties posed by low levels and high fragmentation of cfDNA. cfDNA was isolated from plasma samples of non-pregnant (NP, n = 26) and pregnant (P, n = 26) women using a commercial kit and several elution volumes were evaluated. qPCR parameters were optimized for cfDNA quantification, and several quantities of a recombinant standard were evaluated as internal standard. Absolute quantification was performed using a standard curve and the quality of the complete method was evaluated. cfDNA was eluted in a 50-μl volume, actin-β (ACTB) was selected as the target gene, and qPCR parameters were optimized. The ACTB standard was constructed and 1000 copies were selected as internal standard. The standard curve showed R 2 = 0.993 and E = 109.7%, and the linear dynamic range was defined between 102 and 106 ACTB copies/tube. Repeatability and reproducibility in terms of CV were 19% and up to 49.5% for ACTB copies per milliliter of plasma, respectively. The range of cfDNA levels was 428–18,851 copies/mL in NP women and 4031–2,019,363 copies/mL in P women, showing significant differences between the groups. We recommend the application of internal standard strategy for a reliable plasma cfDNA quantification. This methodology holds great potential for a future application in the obstetric field.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
SAGE Publications
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
CFDNA ISOLATION
dc.subject
CFDNA QUANTIFICATION
dc.subject
PLASMA CELL-FREE DNA
dc.subject
PREGNANCY-RELATED COMPLICATIONS
dc.subject.classification
Otras Ciencias Médicas
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dc.subject.classification
Otras Ciencias Médicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS MÉDICAS Y DE LA SALUD
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dc.title
A Reliable Method for Quantifying Plasma Cell-Free DNA Using an Internal Standard Strategy: Evaluation in a Cohort of Non-Pregnant and Pregnant Women
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2024-02-06T11:01:20Z
dc.journal.pagination
1-10
dc.journal.pais
Estados Unidos
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dc.description.fil
Fil: Cepeda, Paula Julieta. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Salud y Ambiente del Litoral. Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Salud y Ambiente del Litoral; Argentina
dc.description.fil
Fil: Racca, María Emilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Salud y Ambiente del Litoral. Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Salud y Ambiente del Litoral; Argentina
dc.description.fil
Fil: Rossetti, María Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Salud y Ambiente del Litoral. Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Salud y Ambiente del Litoral; Argentina
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Fil: Cardozo, M. Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Salud y Ambiente del Litoral. Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Salud y Ambiente del Litoral; Argentina
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Fil: Gaydou, Luisa. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Salud y Ambiente del Litoral. Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Salud y Ambiente del Litoral; Argentina
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Fil: Luque, Enrique Hugo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Salud y Ambiente del Litoral. Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Salud y Ambiente del Litoral; Argentina
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Fil: Muñoz-de-Toro, Mónica. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Salud y Ambiente del Litoral. Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Salud y Ambiente del Litoral; Argentina
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Fil: Milesi, Maria Mercedes. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Salud y Ambiente del Litoral. Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Salud y Ambiente del Litoral; Argentina
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Fil: Varayoud, Jorgelina Guadalupe. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Salud y Ambiente del Litoral. Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Salud y Ambiente del Litoral; Argentina
dc.description.fil
Fil: Ramos, Jorge Guillermo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Santa Fe. Instituto de Salud y Ambiente del Litoral. Universidad Nacional del Litoral. Instituto de Salud y Ambiente del Litoral; Argentina
dc.journal.title
Reproductive Sciences
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://link.springer.com/article/10.1007/s43032-023-01403-9
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1007/s43032-023-01403-9
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