Mostrar el registro sencillo del ítem
dc.contributor.author
Selva, Juan Pablo
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.contributor.author
Garbus, Ingrid
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.contributor.author
Pasten, Maria Cielo
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.contributor.author
Carballo, José
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.contributor.author
Zappacosta, Diego Carlos
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.contributor.author
Pellino, Marco
dc.contributor.author
Sharbel, Timoty
dc.contributor.author
Echenique, Carmen Viviana
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.date.available
2024-02-05T12:33:23Z
dc.date.issued
2018
dc.identifier.citation
Array-based comparative study of apomicitc and sexual Eragrostis curvula genotypes; Plant and Animal Genome XXVI Conference (PAG); San Diego; Estados Unidos; 2018; 1-2
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/225697
dc.description.abstract
Apomixis is an asexual reproductive process that results in seeds containing maternal clones since meiotic reduction and egg cell fertilization does not occur. Apomixis is common in polyploid grasses, and poorly represented in crop species of economic interest. A key goal in understanding the molecular basis of apomixis is the possible transference of this trait to species of agronomic relevance. Weeping lovegrass (Eragrostis curvula [Schrad.] Nees) is a perennial grass native to Southern Africa that reproduces by diplosporous apomixis. A custom 60-mer spots Agilent array was designed with 970 k probes based on a reference transcriptome constructed from inflorescence of sexual and apomictic genotypes. Eight independent hybridizations were performed with one-color Cy3 labelled samples (four apomictic and four sexual E. curvula genotypes). Data preprocessing and analysis was performed using the GeneSpring software v. 14.5. Platform quality was verified by Agilent spike-in controls. Normalization procedures consisted on percentile shift 75, background correction, median as baseline and reproductive mode as parameter. Individual probes from the array were considered to be differentially hybridized under the log2 transformed Fold Change data > 1 and p-values > 0.01 using unpaired t-test and multiple Benjamini-Hochberg correction. From these analyses 138 differential 60-mer sequences were obtained and four candidate genes strongly expressed in apomictic plants were identified. These genes could be have an important role in apomeiosis induction in weeping lovegrass and its relevance is currently being analysed through several complementary approaches, including in situ hybridization and obtention of Arabidopsis transformant.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Plant and Animal Genome
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
MICROARRAYS
dc.subject
APOMIXIS
dc.subject
ERAGROSTIS CURVULA
dc.subject
GENE EXPRESSION
dc.subject.classification
Biotecnología Agrícola y Biotecnología Alimentaria
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.subject.classification
Biotecnología Agropecuaria
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.subject.classification
CIENCIAS AGRÍCOLAS
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.title
Array-based comparative study of apomicitc and sexual Eragrostis curvula genotypes
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type
info:eu-repo/semantics/conferenceObject
dc.type
info:ar-repo/semantics/documento de conferencia
dc.date.updated
2024-01-19T10:17:46Z
dc.journal.pagination
1-2
dc.journal.pais
Estados Unidos
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.journal.ciudad
San Diego
dc.description.fil
Fil: Selva, Juan Pablo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; Argentina. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Biología, Bioquímica y Farmacia; Argentina
dc.description.fil
Fil: Garbus, Ingrid. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; Argentina. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Ciencias de la Salud; Argentina
dc.description.fil
Fil: Pasten, Maria Cielo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; Argentina
dc.description.fil
Fil: Carballo, José. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; Argentina
dc.description.fil
Fil: Zappacosta, Diego Carlos. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; Argentina. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Agronomía; Argentina
dc.description.fil
Fil: Pellino, Marco. Global Institute for Food Security; Canadá
dc.description.fil
Fil: Sharbel, Timoty. Global Institute for Food Security; Canadá
dc.description.fil
Fil: Echenique, Carmen Viviana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Bahía Blanca. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida. Universidad Nacional del Sur. Centro de Recursos Naturales Renovables de la Zona Semiárida; Argentina. Universidad Nacional del Sur. Departamento de Agronomía; Argentina
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://www.intlpag.org
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://plan.core-apps.com/pag_2018/abstract/ea4431cd14b6570e9d2f2a543c1ddfc6
dc.conicet.rol
Autor
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.conicet.rol
Autor
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.conicet.rol
Autor
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.conicet.rol
Autor
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.conicet.rol
Autor
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.conicet.rol
Autor
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.conicet.rol
Autor
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.conicet.rol
Autor
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.coverage
Internacional
dc.type.subtype
Congreso
dc.description.nombreEvento
Plant and Animal Genome XXVI Conference (PAG)
dc.date.evento
2018-01-13
dc.description.ciudadEvento
San Diego
dc.description.paisEvento
Estados Unidos
![Se ha confirmado la validez de este valor de autoridad por un usuario](/themes/CONICETDigital/images/authority_control/invisible.gif)
dc.type.publicacion
Book
dc.description.institucionOrganizadora
Plant and Animal Genome
dc.source.libro
Plant and Animal Genome XXVI Conference (PAG)
dc.date.eventoHasta
2018-01-17
dc.type
Congreso
Archivos asociados