The importance of deep genotyping in crop breeding

Abstract

One of the greatest challenges facing humanity is the development of sustainable strategiesto ensure food availability in response to population growth and climate change. Oneapproach that can contribute to increase food security is to close yield gaps and enhancinggenetic gain; to such end, what is known as “molecular breeding” plays a fundamental role.Since a crop breeding program is mainly based on the quality of the germplasm, its detailedgenetic characterization is mandatory to ensure the efficient use of genetic resourcesand accelerating development of superior varieties. Deep genotyping is an essential toolfor a comprehensive characterization of the germplasm of interest and, fortunately, thetechnology is now accessible at a reasonable cost. What must be ensured is the correctinterpretation of the genotypic information and on that basis develop efficient practicalmolecular crop breeding strategies that respond to the real needs of the breeding program.

Uno de los mayores desafíos que enfrenta la humanidad es el desarrollo de estrategias sostenibles para asegurar la disponibilidad de alimentos en respuesta al crecimiento de la población y el cambio climático. Un enfoque que puede contribuir a aumentar la seguridad alimentaria es cerrar las brechas de rendimiento y mejorar la ganancia genética; para tal fin, lo que se conoce como “mejoramiento molecular” juega un papel fundamental. Dado que un programa de mejoramiento de cultivos se basa principalmente en la calidad del germoplasma, su caracterización genética detallada es fundamental para garantizar el uso eficiente de los recursos genéticos y acelerar el desarrollo de variedades superiores. La genotipificación profunda es una herramienta esencial para una caracterización integral del germoplasma de interés y, afortunadamente, en la actualidad se puede acceder a la tecnología a un costo razonable. Lo que debe asegurarse es la interpretación correcta de la información genotípica y sobre esa base desarrollar estrategias eficientes y prácticas de mejoramiento molecular de cultivos que respondan a las necesidades reales del programa de mejoramiento.