Molecular techniques based on ITS analysis: useful tools for the identification of wood-decay Basidiomycetes in urban trees?

Abstract

The presence and identity of wood-decay Basidiomycetes affecting Platanus acerifolia were evaluated in Buenos Aires City during 2007. From 247 samples of basidiomes and wood with signs of decay, 19 strains were isolated, from which 10 rDNA sequences were obtained. The aim of this work was to analyze the scope of information obtained from ITS sequences as taxonomic tools to study local populations of wood-rotting fungi in urban trees. Phylogenetic analyses were performed under static and dynamic homologies. The techniques employed enable to: identificate Coprinellus micaceus and corroborate the identification of Bjerkandera adusta, while these same results were not achieved for Inonotus rickii, Ganoderma resinaceum, Peniophora laxitexta and Phlebiopsis gigantea due to the complexity of the genera and the lack of sequences. Lack of sequences at a regional level would be a major obstacle for the detection of wood decay agents in urban trees using ITS sequences.

Durante 2007 se evaluó la presencia e identidad de Basidiomycetes xilófagos que afectan a Platanus acerifolia en la Ciudad de Buenos Aires. Sobre la base de 247 muestras de basidiomas y madera con signos de pudrición se aislaron 19 cepas, a partir de las cuales se obtuvieron 10 secuencias correspondientes a rADN. El objetivo de este trabajo fue analizar la utilidad de la información brindada por las secuencias correspondientes al fragmento ITS en la identificación taxonómica de poblaciones locales de hongos xilófagos en árboles urbanos. Se realizaron análisis filogenéticos bajo homologías estáticas y dinámicas. Los resultados obtenidos fueron comparados con las identificaciones morfológicas y de cultivo previas de las cepas. Las técnicas empleadas permitieron: identificar a Coprinellus micaceus y corroborar la identificación de Bjerkandera adusta, mientras que no se lograron los mismos resultados, debido a la complejidad de los géneros y a la ausencia de secuencias, para Inonotus rickii, Ganoderma resinaceum, Peniophora laxitexta y Phlebiopsis gigantea. La falta de secuencias a nivel regional aparece como uno de los principales obstáculos para la detección de agentes de pudrición de la madera en árboles urbanos, mediante los análisis basados en secuencias ITS.