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dc.contributor.author
Sucar, Sofia
dc.contributor.author
Carboni, Martín Federico
dc.contributor.author
Rey, María Florencia
dc.contributor.author
Castellote, Martín Alfredo
dc.contributor.author
Massa, Gabriela Alejandra
dc.contributor.author
Monte, Marcelo Nicolás
dc.contributor.author
Feingold, Sergio Enrique
dc.date.available
2023-10-27T14:46:52Z
dc.date.issued
2022-01
dc.identifier.citation
Sucar, Sofia; Carboni, Martín Federico; Rey, María Florencia; Castellote, Martín Alfredo; Massa, Gabriela Alejandra; et al.; Assessment of Genetic Diversity and Relatedness in an Andean Potato Collection from Argentina by High-Density Genotyping; MDPI; Horticulturae; 8; 1; 1-2022; 1-17
dc.identifier.issn
2311-7524
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/216218
dc.description.abstract
Native potatoes are the most diverse among cultivated potato species and thus constitute a valuable source for identifying genes for potato improvement. Nevertheless, high-density mapping, needed to reveal allelic diversity, has not been performed for native Argentinian potatoes. We present a study of the genetic variability and population structure of 96 Andigena potatoes from Northwestern Argentina performed using a subset of 5035 SNPs with no missing data and full reproducibility. These high-density markers are distributed across the genome and present a good coverage of genomic regions. A Bayesian approach revealed the presence of: (I) a major group comprised of most of the Andean accessions; (II) a smaller group containing the out-group cv. Spunta and the sequenced genotype DM; and (III) a third group containing colored flesh potatoes. This grouping was also consistent when maximum likelihood trees were constructed and further confirmed by a principal coordinate analysis. A group of 19 accessions stored as Andean varieties clustered consistently with group Tuberosum accessions. This was in agreement with previous studies and we hypothesized that they may be reintroductions of European-bred long day-adapted potatoes. The present study constitutes a valuable source for allele mining of genes of interest and thus provides a tool for association mapping studies.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
MDPI
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by/2.5/ar/
dc.subject
ANDEAN POTATO
dc.subject
DARTSEQ MARKERS
dc.subject
GENETIC DIVERSITY
dc.subject
GERMPLASM
dc.subject
POPULATION STRUCTURE
dc.subject.classification
Otros Tópicos Biológicos
dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.title
Assessment of Genetic Diversity and Relatedness in an Andean Potato Collection from Argentina by High-Density Genotyping
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2023-10-26T15:22:10Z
dc.journal.volume
8
dc.journal.number
1
dc.journal.pagination
1-17
dc.journal.pais
Suiza
dc.journal.ciudad
Basel
dc.description.fil
Fil: Sucar, Sofia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible; Argentina
dc.description.fil
Fil: Carboni, Martín Federico. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Museo Argentino de Ciencias Naturales "Bernardino Rivadavia"; Argentina
dc.description.fil
Fil: Rey, María Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible; Argentina
dc.description.fil
Fil: Castellote, Martín Alfredo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible; Argentina
dc.description.fil
Fil: Massa, Gabriela Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible; Argentina
dc.description.fil
Fil: Monte, Marcelo Nicolás. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible; Argentina
dc.description.fil
Fil: Feingold, Sergio Enrique. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible - Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro Regional Buenos Aires Sur. Estación Experimental Agropecuaria Balcarce. Instituto de Innovación para la Producción Agropecuaria y el Desarrollo Sostenible; Argentina
dc.journal.title
Horticulturae
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.mdpi.com/2311-7524/8/1/54
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.3390/horticulturae8010054
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