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dc.contributor.author
Navarro, Alvaro Martin
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dc.contributor.author
Orti, Fernando Ezequiel
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dc.contributor.author
Martinez Perez, Elizabeth
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dc.contributor.author
Alonso, Macarena
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dc.contributor.author
Simonetti, Franco Lucio
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dc.contributor.author
Iserte, Javier Alonso
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dc.contributor.author
Marino Buslje, Cristina
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dc.date.available
2023-10-26T19:49:06Z
dc.date.issued
2022-01
dc.identifier.citation
Navarro, Alvaro Martin; Orti, Fernando Ezequiel; Martinez Perez, Elizabeth; Alonso, Macarena; Simonetti, Franco Lucio; et al.; DisPhaseDB: An integrative database of diseases related variations in liquid–liquid phase separation proteins; Elsevier; Computational and Structural Biotechnology Journal; 20; 1-2022; 2551-2557
dc.identifier.issn
2001-0370
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/216120
dc.description.abstract
Motivation: Proteins involved in liquid–liquid phase separation (LLPS) and membraneless organelles (MLOs) are recognized to be decisive for many biological processes and also responsible for several diseases. The recent explosion of research in the area still lacks tools for the analysis and data integration among different repositories. Currently, there is not a comprehensive and dedicated database that collects all disease-related variations in combination with the protein location, biological role in the MLO, and all the metadata available for each protein and disease. Disease-related protein variants and additional features are dispersed and the user has to navigate many databases, with a different focus, formats, and often not user friendly. Results: We present DisPhaseDB, a database dedicated to disease-related variants of liquid–liquid phase separation proteins. It integrates 10 databases, contains 5,741 proteins, 1,660,059 variants, and 4,051 disease terms. It also offers intuitive navigation and an informative display. It constitutes a pivotal starting point for further analysis, encouraging the development of new computational tools. The database is freely available at http://disphasedb.leloir.org.ar.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Elsevier
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/2.5/ar/
dc.subject
DATABASE
dc.subject
DISEASE VARIATIONS
dc.subject
DISEASES
dc.subject
LIQUID–LIQUID PHASE SEPARATION PROTEINS
dc.subject
LLPS
dc.subject
MEMBRANE-LESS ORGANELLES
dc.subject
MLO
dc.subject
WEB SERVER
dc.subject.classification
Otros Tópicos Biológicos
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
DisPhaseDB: An integrative database of diseases related variations in liquid–liquid phase separation proteins
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2023-10-26T15:10:26Z
dc.journal.volume
20
dc.journal.pagination
2551-2557
dc.journal.pais
Países Bajos
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dc.journal.ciudad
Amsterdam
dc.description.fil
Fil: Navarro, Alvaro Martin. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina
dc.description.fil
Fil: Orti, Fernando Ezequiel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina
dc.description.fil
Fil: Martinez Perez, Elizabeth. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina
dc.description.fil
Fil: Alonso, Macarena. Fundación Instituto Leloir; Argentina
dc.description.fil
Fil: Simonetti, Franco Lucio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina
dc.description.fil
Fil: Iserte, Javier Alonso. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires. Fundación Instituto Leloir. Instituto de Investigaciones Bioquímicas de Buenos Aires; Argentina
dc.description.fil
Fil: Marino Buslje, Cristina. Fundación Instituto Leloir; Argentina
dc.journal.title
Computational and Structural Biotechnology Journal
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S200103702200160X
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://doi.org/10.1016/j.csbj.2022.05.004
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