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dc.contributor.author
Molinet, Jennifer
dc.contributor.author
Eizaguirre, Juan Ignacio
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dc.contributor.author
Quintrel, Pablo
dc.contributor.author
Bellora, Nicolás
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dc.contributor.author
Villarroel, Carlos A.
dc.contributor.author
Villarreal, Pablo
dc.contributor.author
Benavides Parra, José
dc.contributor.author
Nespolo, Roberto F.
dc.contributor.author
Libkind Frati, Diego
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dc.contributor.author
Cubillos, Francisco A.
dc.date.available
2023-10-05T14:47:11Z
dc.date.issued
2022-12
dc.identifier.citation
Molinet, Jennifer; Eizaguirre, Juan Ignacio; Quintrel, Pablo; Bellora, Nicolás; Villarroel, Carlos A.; et al.; Natural Variation in Diauxic Shift between Patagonian Saccharomyces eubayanus Strains; American Society for Microbiology; mSystems; 7; 6; 12-2022; 1-18
dc.identifier.issn
2379-5077
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/214241
dc.description.abstract
The study of natural variation can untap novel alleles with immense value for biotechnological applications. Saccharomyces eubayanus Patagonian isolates exhibit differences in the diauxic shift between glucose and maltose, representing a suitable model to study their natural genetic variation for novel strains for brewing. However, little is known about the genetic variants and chromatin regulators responsible for these differences. Here, we show how genome-wide chromatin accessibility and gene expression differences underlie distinct diauxic shift profiles in S. eubayanus. We identified two strains with a rapid diauxic shift between glucose and maltose (CL467.1 and CBS12357) and one strain with a remarkably low fermentation efficiency and longer lag phase during diauxic shift (QC18). This is associated in the QC18 strain with lower transcriptional activity and chromatin accessibility of specific genes of maltose metabolism and higher expression levels of glucose transporters. These differences are governed by the HAP complex, which differentially regulates gene expression depending on the genetic background. We found in the QC18 strain a contrasting phenotype to those phenotypes described in S. cerevisiae, where hap4D, hap5D, and cin5D knockouts significantly improved the QC18 growth rate in the glucose-maltose shift. The most profound effects were found between CIN5 allelic variants, suggesting that Cin5p could strongly activate a repressor of the diauxic shift in the QC18 strain but not necessarily in the other strains. The differences between strains could originate from the tree host from which the strains were obtained, which might determine the sugar source preference and the brewing potential of the strain.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
American Society for Microbiology
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
Diauxic Shift
dc.subject
Saccharomyces eubayanus
dc.subject
Patagonia
dc.subject
Lager beer
dc.subject.classification
Bioprocesamiento Tecnológico, Biocatálisis, Fermentación
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dc.subject.classification
Biotecnología Industrial
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dc.subject.classification
INGENIERÍAS Y TECNOLOGÍAS
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dc.title
Natural Variation in Diauxic Shift between Patagonian Saccharomyces eubayanus Strains
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2023-07-14T10:45:52Z
dc.journal.volume
7
dc.journal.number
6
dc.journal.pagination
1-18
dc.journal.pais
Estados Unidos
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dc.description.fil
Fil: Molinet, Jennifer. Universidad de Santiago de Chile; Chile
dc.description.fil
Fil: Eizaguirre, Juan Ignacio. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto Andino Patagónico de Tecnologías Biológicas y Geoambientales. Universidad Nacional del Comahue. Instituto Andino Patagónico de Tecnologías Biológicas y Geoambientales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Quintrel, Pablo. Universidad de Santiago de Chile; Chile
dc.description.fil
Fil: Bellora, Nicolás. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Comisión Nacional de Energía Atómica. Gerencia de Área de Aplicaciones de la Tecnología Nuclear. Instituto de Tecnologías Nucleares para la Salud; Argentina
dc.description.fil
Fil: Villarroel, Carlos A.. Universidad de Talca; Chile
dc.description.fil
Fil: Villarreal, Pablo. Universidad de Santiago de Chile; Chile
dc.description.fil
Fil: Benavides Parra, José. Universidad de Santiago de Chile; Chile
dc.description.fil
Fil: Nespolo, Roberto F.. Universidad Austral de Chile; Chile
dc.description.fil
Fil: Libkind Frati, Diego. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Norte. Instituto Andino Patagónico de Tecnologías Biológicas y Geoambientales. Universidad Nacional del Comahue. Instituto Andino Patagónico de Tecnologías Biológicas y Geoambientales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Cubillos, Francisco A.. Universidad de Santiago de Chile; Chile
dc.journal.title
mSystems
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://journals.asm.org/doi/10.1128/msystems.00640-22
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1128/msystems.00640-22
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