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dc.contributor.author
Anello, Melina
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dc.contributor.author
Daverio, Maria Silvana
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dc.contributor.author
Rodríguez, Silvia Susana
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dc.contributor.author
Romero, S. R.
dc.contributor.author
Renieri, C.
dc.contributor.author
Arbeletche, Lidia Beatriz
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dc.contributor.author
Di Rocco, Florencia
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dc.date.available
2023-08-29T13:15:33Z
dc.date.issued
2022-01
dc.identifier.citation
Anello, Melina; Daverio, Maria Silvana; Rodríguez, Silvia Susana; Romero, S. R.; Renieri, C.; et al.; The ASIP gene in the llama (Lama glama): Alternative transcripts, expression and relation with color phenotypes; Elsevier Science; Gene; 809; 1-2022; 1-8
dc.identifier.issn
0378-1119
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/209688
dc.description.abstract
The Agouti gene (ASIP) is one of the most important genes for coat color determination in mammals. It has a complex structure with several promoters and alternative non-coding first exons that are transcribed into mRNAs with different 5'UTR. These mRNA isoforms regulate the temporal and spatial expression of the gene, producing diverse pigmentation patterns. Here, we studied ASIP transcriptional variants and their expression in the skin of llamas with different coat color phenotypes. We also described the ASIP locus, including promoter usage and the splicing events that originate each transcript variant. Using 5'RACE-PCR we isolated seven ASIP transcripts with alternative 5′UTR, where exons 1A, 1A’, 1C, 1D, and a novel non-coding exon 1A” were identified. Additionally, new alternative spliced forms were found. The diversity of ASIP 5′UTRs is originated by a complex pattern of alternative promoter usage, multiple transcription start sites and splicing events that include exon skipping and alternative 3′ splicing site selection. We found that ASIP was highly expressed in llamas with white and brown phenotypes while black animals presented very low expression. The main responsible for this difference was a fusion transcript between ASIP and NCOA6 genes, which was present in the skin of white and brown llamas but not in the black ones. The rest of ASIP transcripts presented very low expression in the skin, indicating that the main regulation point for ASIP gene expression is at the transcriptional level. Nevertheless, the characteristics of the 5′UTRs sequences suggest that alternative transcripts could be regulated differently at the protein synthesis level.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Elsevier Science
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
5′UTR
dc.subject
ALTERNATIVE SPLICING
dc.subject
COAT COLOR
dc.subject
GENE EXPRESSION
dc.subject
MRNA VARIANTS
dc.subject.classification
Ciencias Veterinarias
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dc.subject.classification
Ciencias Veterinarias
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dc.subject.classification
CIENCIAS AGRÍCOLAS
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dc.title
The ASIP gene in the llama (Lama glama): Alternative transcripts, expression and relation with color phenotypes
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2023-07-04T13:35:16Z
dc.journal.volume
809
dc.journal.pagination
1-8
dc.journal.pais
Países Bajos
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dc.journal.ciudad
Amsterdam
dc.description.fil
Fil: Anello, Melina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Daverio, Maria Silvana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Rodríguez, Silvia Susana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Romero, S. R.. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigación y Desarrollo Tecnológico para la Agricultura Familiar; Argentina
dc.description.fil
Fil: Renieri, C.. Universita Degli Di Camerino; Italia
dc.description.fil
Fil: Arbeletche, Lidia Beatriz. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Di Rocco, Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular. Universidad Nacional de La Plata. Instituto Multidisciplinario de Biología Celular; Argentina
dc.journal.title
Gene
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S0378111921006132
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1016/j.gene.2021.146018
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