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dc.contributor.author
Rudd Garces, Gabriela
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dc.contributor.author
Peral Garcia, Pilar
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dc.contributor.author
Padula, Gisel
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dc.contributor.author
Giovambattista, Guillermo
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dc.date.available
2023-08-23T14:13:34Z
dc.date.issued
2021
dc.identifier.citation
Transcriptomic profile of peripheral whole blood reveals novel potential diagnostic gene biomarkers of degenerative joint disease (osteoarthritis) in German shepherd dogs; 38th International Society for Animal Genetics Virtual Conference (2021); Estados Unidos; 2021; 69-69
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/209062
dc.description.abstract
Degenerative joint disease (osteoarthritis) is one of the most common chronic musculoskeletal diseases in human population. Susceptibility to osteoarthritis has been associated with more than 90 quantitative trait loci (QTL). Canine forms of degenerative joint disease are very similar to those in humans and represent a welfare problem in the dog world population. In this study, we Investigated the transcriptomic profile of peripheral whole blood in German shepherd dogs with degenerative joint disease to identify biomarkers. The bulk RNA-seq experiment was performed in a cohort of 12 adult dogs, 5 affected and 7 unaffected. Radiographs in affected dogs revealed severe osteoarthritis in hip and elbow joints. The differential expression analysis showed 688 genes differentially expressed in comparison to the control group (P-value <0.05). This pool of genes was functional annotated for signaling pathways using PANTHER tools. The enriched genes were those associated with inflammation mediate by chemokine and cytokine signaling pathway. To gain further insights of the functional role of these genes in osteoarthritis, we selected those with foldchange values less or equal to −2.0 and bigger or equal to 2.0. We found 8 genes highly upregulated and 9 genes strongly downregulated. Prioritization of these genes according to their functional knowledge revealed 2 clear top candidate biomarkers. The downregulated OSCAR gene encodes the osteoclast associated protein which is involved in the regulation ofosteoclastogenesis and bone homeostasis. On the other hand, the upregulated TRPM2 gene is involved in oxidative stress-induced cell death and inflammation processes. Our data suggests OSCAR and TRPM2 as novel candidate biomarkers for degenerative joint disease in German shepherds, this may facilitate genetic testing to improve the diagnosis and clinical treatment.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
International Society for Animal Genetics
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
DOGS AND RELATED SPECIES
dc.subject
ANINMAL BREEDING
dc.subject
RNA-SEQ
dc.subject
GENE EXPRESSION
dc.subject.classification
Otras Ciencias Veterinarias
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dc.subject.classification
Ciencias Veterinarias
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dc.subject.classification
CIENCIAS AGRÍCOLAS
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dc.title
Transcriptomic profile of peripheral whole blood reveals novel potential diagnostic gene biomarkers of degenerative joint disease (osteoarthritis) in German shepherd dogs
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type
info:eu-repo/semantics/conferenceObject
dc.type
info:ar-repo/semantics/documento de conferencia
dc.date.updated
2022-11-09T16:46:18Z
dc.journal.pagination
69-69
dc.journal.pais
Estados Unidos
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dc.journal.ciudad
Champaign
dc.description.fil
Fil: Rudd Garces, Gabriela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina
dc.description.fil
Fil: Peral Garcia, Pilar. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina
dc.description.fil
Fil: Padula, Gisel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina
dc.description.fil
Fil: Giovambattista, Guillermo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico CONICET- La Plata. Instituto de Genética Veterinaria "Ing. Fernando Noel Dulout". Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Veterinarias. Instituto de Genética Veterinaria; Argentina
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.isag.us/Docs/Proceedings/ISAG2021_Proceedings.pdf?v=20211015
dc.conicet.rol
Autor
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dc.coverage
Internacional
dc.type.subtype
Conferencia
dc.description.nombreEvento
38th International Society for Animal Genetics Virtual Conference (2021)
dc.date.evento
2021-07-26
dc.description.paisEvento
Estados Unidos
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dc.type.publicacion
Journal
dc.description.institucionOrganizadora
International Society for Animal Genetics
dc.source.revista
ISAG 2021 Abstract Book
dc.date.eventoHasta
2021-07-30
dc.type
Conferencia
Archivos asociados