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Chaves, Solana
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Ostengo, Santiago
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Bertani, Romina Priscila
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Peña Malavera, Andrea Natalia
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Cuenya, María Inés
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Filippone, María Paula
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Castagnaro, Atilio Pedro
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dc.contributor.author
Balzarini, Monica Graciela
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dc.contributor.author
Racedo, Josefina
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dc.date.available
2023-08-16T20:18:10Z
dc.date.issued
2022-06
dc.identifier.citation
Chaves, Solana; Ostengo, Santiago; Bertani, Romina Priscila; Peña Malavera, Andrea Natalia; Cuenya, María Inés; et al.; Novel alleles linked to brown rust resistance in sugarcane; Wiley Blackwell Publishing, Inc; Plant Pathology; 71; 8; 6-2022; 1688-1699
dc.identifier.issn
0032-0862
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/208526
dc.description.abstract
Sugarcane brown rust, caused by Puccinia melanocephala, is a severe foliar disease that occurs in almost all countries where sugarcane is grown. The main control strategy is the use of resistant cultivars. The aim of this work was to identify molecular markers linked to genomic regions associated with a novel brown rust resistance source in sugarcane. An F1 progeny of 300 clones was obtained from a cross between TUC 00–36 and RA 87–3, highly susceptible and highly resistant to brown rust, respectively. A total of 60 F1 clones with extreme phenotype, either highly susceptible or highly resistant to brown rust, were selected. This “pooled tail” population was tested for reactions to brown rust under natural infection in the field during two crop seasons and under artificial infection in the greenhouse. Whole-genome profiling was performed by DArT-seq technology. Phenotypic data under both conditions and 23,299 single-nucleotide polymorphisms (SNPs) obtained from genotyping were analysed to identify markers linked to the resistance trait. Single mapping analyses and subsequent multiple regression showed that 34 SNP markers were significantly linked to resistance alleles. These SNPs jointly explained 69% and 66% of the total phenotypic variation (R2) observed for field and controlled conditions, respectively. The mapping of the 34 SNP sequences revealed that 19 markers aligned to the sugarcane genome, whereas 12 markers aligned to the sorghum genome, all grouped on chromosome 5 with some functional annotations related to vegetal defence response. These marker loci could contribute to the development of molecular tools for molecular marker-assisted breeding.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Wiley Blackwell Publishing, Inc
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
DART-SEQ
dc.subject
MOLECULAR MARKERS
dc.subject
PUCCINIA MELANOCEPHALA
dc.subject
SACCHARUM SP.
dc.subject.classification
Biotecnología Agrícola y Biotecnología Alimentaria
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dc.subject.classification
Biotecnología Agropecuaria
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dc.subject.classification
CIENCIAS AGRÍCOLAS
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dc.title
Novel alleles linked to brown rust resistance in sugarcane
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2023-08-08T12:43:43Z
dc.journal.volume
71
dc.journal.number
8
dc.journal.pagination
1688-1699
dc.journal.pais
Reino Unido
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dc.journal.ciudad
Londres
dc.description.fil
Fil: Chaves, Solana. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino. Provincia de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial "Obispo Colombres" (p). Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentina
dc.description.fil
Fil: Ostengo, Santiago. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino. Provincia de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial "Obispo Colombres" (p). Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentina
dc.description.fil
Fil: Bertani, Romina Priscila. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino. Provincia de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial "Obispo Colombres" (p). Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentina
dc.description.fil
Fil: Peña Malavera, Andrea Natalia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino. Provincia de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial "Obispo Colombres" (p). Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentina
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Fil: Cuenya, María Inés. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino. Provincia de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial "Obispo Colombres" (p). Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentina
dc.description.fil
Fil: Filippone, María Paula. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino. Provincia de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial "Obispo Colombres" (p). Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentina
dc.description.fil
Fil: Castagnaro, Atilio Pedro. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino. Provincia de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial "Obispo Colombres" (p). Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentina. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Agronomía y Zootecnia; Argentina
dc.description.fil
Fil: Balzarini, Monica Graciela. Instituto Nacional de Tecnologia Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola. - Consejo Nacional de Investigaciones Cientificas y Tecnicas. Centro Cientifico Tecnologico Conicet - Cordoba. Unidad de Fitopatologia y Modelizacion Agricola.; Argentina. Universidad Católica de Córdoba. Facultad de Ciencias Agropecuarias; Argentina
dc.description.fil
Fil: Racedo, Josefina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino. Provincia de Tucumán. Ministerio de Desarrollo Productivo. Estación Experimental Agroindustrial "Obispo Colombres" (p). Instituto de Tecnología Agroindustrial del Noroeste Argentino; Argentina
dc.journal.title
Plant Pathology
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dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://bsppjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/ppa.13605
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/https://doi.org/10.1111/ppa.13605
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