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dc.contributor.author
Ojeda, Agustina Alejandra
dc.contributor.author
Novillo, Agustina
dc.contributor.author
Lanzone, Cecilia
dc.contributor.author
Rodriguez, Maria Daniela
dc.contributor.author
Cuevas, Maria Fernanda
dc.contributor.author
Jayat, Jorge Pablo
dc.contributor.author
Teta, Pablo Vicente
dc.contributor.author
Ojeda, Ricardo Alberto
dc.contributor.author
Borisenko, Alex
dc.date.available
2023-08-09T10:33:04Z
dc.date.issued
2022-02-24
dc.identifier.citation
Ojeda, Agustina Alejandra; Novillo, Agustina; Lanzone, Cecilia; Rodriguez, Maria Daniela; Cuevas, Maria Fernanda; et al.; DNA barcodes highlight genetic diversity patterns in rodents from lowland desert and Andean areas in Argentina; Wiley Blackwell Publishing, Inc; Molecular Ecology Resources; 22; 6; 24-2-2022; 2349-2362
dc.identifier.issn
1755-098X
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/207517
dc.description.abstract
Rodents are an important component of South America fauna. Their high diversity has motivated researchers to continually review their taxonomy, genetic diversity, species limits, and phylogenetic relationships. Here, we applied DNA-barcodes for assessing the taxonomic and genetic diversity in the two major lineages of South American rodents: caviomorphs and sigmodontines. We analysed 335 COI barcodes in 34 morphologically determined species from 39 localities along central Andes and arid lands of Argentina. Neighbour-joining and maximum likelihood reconstruction provided clear separation between species. The Barcode Index number and Bayesian Poisson tree processes were used to confirm concordance between sequence clusters and species designations by taxonomy. We found deep divergence within the Phyllotis xanthopygus species complex, with distances up to 13.0% between geographically separated lineages. Minor divergences (3.30% and 2.52%) were found within Abrothrix hirta, and Tympanoctomys barrerae, respectively, with differentiation in their genetic lineages. Also, we documented geographically separated clusters for Akodon spegazzinii and A. oenos with up to 2.3% divergence, but clustering methods failed to distinguish them as different species. Sequence results show a clear barcode gap with a mean intraspecific divergence (0.56%) versus a minimum nearest-neighbour distance averaging (10.1%). Distances between congeneric species varied from 4.1 to 14%, with the exception of two related forms within Euneomys and the sister species Akodon spegazzinii and A. oenos. This study constitutes a substantial contribution to the global barcode reference library. It provides insights into the complex phylogeographic patterns and speciation scenarios in rodents, while highlighting areas that require in-depth taxonomic and integrative research.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Wiley Blackwell Publishing, Inc
dc.rights
info:eu-repo/semantics/restrictedAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
CAVIOMORPHA
dc.subject
COI
dc.subject
DNA BARCODING
dc.subject
SIGMODONTINAE
dc.subject
SOUTH AMERICA
dc.subject
SPECIES IDENTIFICATION
dc.subject.classification
Zoología, Ornitología, Entomología, Etología
dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.title
DNA barcodes highlight genetic diversity patterns in rodents from lowland desert and Andean areas in Argentina
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2023-06-16T12:51:51Z
dc.journal.volume
22
dc.journal.number
6
dc.journal.pagination
2349-2362
dc.journal.pais
Reino Unido
dc.journal.ciudad
Londres
dc.description.fil
Fil: Ojeda, Agustina Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto Argentino de Investigaciones de las Zonas Áridas. Provincia de Mendoza. Instituto Argentino de Investigaciones de las Zonas Áridas. Universidad Nacional de Cuyo. Instituto Argentino de Investigaciones de las Zonas Áridas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Novillo, Agustina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Tucumán. Instituto de Biodiversidad Neotropical. Universidad Nacional de Tucumán. Facultad de Ciencias Naturales e Instituto Miguel Lillo. Instituto de Biodiversidad Neotropical. Instituto de Biodiversidad Neotropical; Argentina
dc.description.fil
Fil: Lanzone, Cecilia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas | Universidad Nacional de Misiones. Instituto de Biología Subtropical. Instituto de Biología Subtropical - Nodo Posadas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Rodriguez, Maria Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto Argentino de Investigaciones de las Zonas Áridas. Provincia de Mendoza. Instituto Argentino de Investigaciones de las Zonas Áridas. Universidad Nacional de Cuyo. Instituto Argentino de Investigaciones de las Zonas Áridas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Cuevas, Maria Fernanda. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto Argentino de Investigaciones de las Zonas Áridas. Provincia de Mendoza. Instituto Argentino de Investigaciones de las Zonas Áridas. Universidad Nacional de Cuyo. Instituto Argentino de Investigaciones de las Zonas Áridas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Jayat, Jorge Pablo. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico - Tucumán. Unidad Ejecutora Lillo; Argentina
dc.description.fil
Fil: Teta, Pablo Vicente. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Oficina de Coordinación Administrativa Parque Centenario. Museo Argentino de Ciencias Naturales "Bernardino Rivadavia"; Argentina
dc.description.fil
Fil: Ojeda, Ricardo Alberto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mendoza. Instituto Argentino de Investigaciones de las Zonas Áridas. Provincia de Mendoza. Instituto Argentino de Investigaciones de las Zonas Áridas. Universidad Nacional de Cuyo. Instituto Argentino de Investigaciones de las Zonas Áridas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Borisenko, Alex. University Of Guelph. Department Of Integrative Biology.; Canadá
dc.journal.title
Molecular Ecology Resources
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1755-0998.13603
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.1111/1755-0998.13603
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