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dc.contributor.author
Celli, Marcos Giovani
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dc.contributor.author
Pinel Galzi, A.
dc.contributor.author
Filloux, D.
dc.contributor.author
Roumagnac, P.
dc.contributor.author
Hébrard, E.
dc.date.available
2023-06-13T14:06:49Z
dc.date.issued
2021
dc.identifier.citation
Primeras secuencias genómicas completas de dos aislamientos argentinos de Rice stripe necrosis virus; 5º Congreso Argentino de Fitopatología y 59º Reunión APS División Caribe; Corrientes; Argentina; 2021; 209-209
dc.identifier.isbn
978-987-24373-3-6
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/200449
dc.description.abstract
Rice stripe necrosis virus (RSNV) fue reportado en Argentina en 2018 y es el agente causal del entorchamiento del arroz. Es un Benyvirus transmitido por el protista Polymyxa graminis a partir de suelo infectado. La enfermedad denominada “entorchamiento del arroz” debido al síntoma característico de enrulamiento o “zig-zag” de la lámina foliar. El objetivo de este trabajo fue secuenciar el genoma de diferentes aislamientos de RSNV para estudios de variabilidad. Se utilizaron dos estrategias: 1) amplificación con cebadores específicos y secuenciación por método Sanger, y 2) secuenciación masiva por VANA-NGS (Virion-Associated Nucleic Acids - Next-Generation Sequencing). Dos muestras positivas para RSNV provenientes de Berón de Astrada (Corrientes) y de San Javier (Santa Fe) fueron secuenciadas. La amplificación por RTPCR utilizó 6 cebadores para el RNA1 y 8 cebadores para el RNA2. Se secuenció los 3 y 4 fragmentos del RNA1 (6615 nt) y RNA2 (4849 nt), respectivamente. Otra muestra fue sometida a la purificación de partículas por el método VANA seguida de secuenciación en Illumina (HiSeq 1500). Se obtuvo el genoma completo de dos aislamientos. Cuando se comparó con la secuencia de Colombia, presentaron 94,7% de identidad de nt para el RNA1, y 96,6% para el RNA2. El gen más conservado fue el TGB2 con 98.3% de identidad y el más variable fue el gen de la replicasa con 94,7% de identidad. Estas son las primeras secuencias genómicas completas de RSNV de Argentina y posibilitarán el estudio de la variabilidad viral.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
spa
dc.publisher
Asociación Argentina de Fitopatólogos
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
ARROZ
dc.subject
Benyvirus
dc.subject
POLYMYXA
dc.subject.classification
Agricultura
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dc.subject.classification
Agricultura, Silvicultura y Pesca
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dc.subject.classification
CIENCIAS AGRÍCOLAS
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dc.title
Primeras secuencias genómicas completas de dos aislamientos argentinos de Rice stripe necrosis virus
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type
info:eu-repo/semantics/conferenceObject
dc.type
info:ar-repo/semantics/documento de conferencia
dc.date.updated
2022-09-21T15:11:47Z
dc.journal.pagination
209-209
dc.journal.pais
Argentina
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dc.journal.ciudad
Corrientes
dc.description.fil
Fil: Celli, Marcos Giovani. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Instituto de Patología Vegetal; Argentina. Instituto Nacional de Tecnología Agropecuaria. Centro de Investigaciones Agropecuarias. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola - Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Córdoba. Unidad de Fitopatología y Modelización Agrícola; Argentina
dc.description.fil
Fil: Pinel Galzi, A.. Centre National de la Recherche Scientifique. Institut de Recherche pour le Développement; Francia
dc.description.fil
Fil: Filloux, D.. Centre National de la Recherche Scientifique. Institut de Recherche pour le Développement; Francia
dc.description.fil
Fil: Roumagnac, P.. Centre National de la Recherche Scientifique. Institut de Recherche pour le Développement; Francia
dc.description.fil
Fil: Hébrard, E.. Centre National de la Recherche Scientifique. Institut de Recherche pour le Développement; Francia
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/http://aafitopatologos.com.ar/wp/wp-content/uploads/2021/11/Libro-de-Res%C3%BAmenes-5%C2%BACAF-Final.pdf
dc.conicet.rol
Autor
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dc.coverage
Nacional
dc.type.subtype
Congreso
dc.description.nombreEvento
5º Congreso Argentino de Fitopatología y 59º Reunión APS División Caribe
dc.date.evento
2021-09-22
dc.description.ciudadEvento
Corrientes
dc.description.paisEvento
Argentina
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dc.type.publicacion
Book
dc.description.institucionOrganizadora
Asociación Argentina de Fitopatologos
dc.source.libro
Libro de Resúmenes: 5º Congreso Argentino de Fitopatología y 59º Reunión APS División Caribe
dc.date.eventoHasta
2021-09-23
dc.type
Congreso
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