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dc.contributor.author
Sanz, María Belén
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dc.contributor.author
de Belder, Denise Gisele
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dc.contributor.author
de Mendieta, Juan Manuel
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dc.contributor.author
Faccone, Diego Francisco
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dc.contributor.author
Poklepovich, Tomás
dc.contributor.author
Lucero, Celeste
dc.contributor.author
Rapoport, Melina
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dc.contributor.author
Campos, Josefina
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dc.contributor.author
Tuduri, Ezequiel
dc.contributor.author
Saavedra, Mathew O.
dc.contributor.author
Van der Ploeg, Claudia
dc.contributor.author
Rogé, Ariel Diego
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dc.contributor.author
Pasteran, Fernando
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dc.contributor.author
Corso, Alejandra
dc.contributor.author
Rosato, Adriana E.
dc.contributor.author
Gómez, Sonia Alejandra
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dc.date.available
2023-04-26T19:22:25Z
dc.date.issued
2022-03
dc.identifier.citation
Sanz, María Belén; de Belder, Denise Gisele; de Mendieta, Juan Manuel; Faccone, Diego Francisco; Poklepovich, Tomás; et al.; Carbapenemase-Producing Extraintestinal Pathogenic Escherichia coli From Argentina: Clonal Diversity and Predominance of Hyperepidemic Clones CC10 and CC131; Frontiers Media; Frontiers in Microbiology; 13; 3-2022; 1-11
dc.identifier.issn
1664-302X
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/195534
dc.description.abstract
Extraintestinal pathogenic Escherichia coli (ExPEC) causes infections outside the intestine. Particular ExPEC clones, such as clonal complex (CC)/sequence type (ST)131, have been known to sequentially accumulate antimicrobial resistance that starts with chromosomal mutations against fluoroquinolones, followed with the acquisition of blaCTX–M–15 and, more recently, carbapenemases. Here we aimed to investigate the distribution of global epidemic clones of carbapenemase-producing ExPEC from Argentina in representative clinical isolates recovered between July 2008 and March 2017. Carbapenemase-producing ExPEC (n = 160) were referred to the Argentinean reference laboratory. Of these, 71 were selected for genome sequencing. Phenotypic and microbiological studies confirmed the presence of carbapenemases confirmed as KPC-2 (n = 52), NDM-1 (n = 16), IMP-8 (n = 2), and VIM-1 (n = 1) producers. The isolates had been recovered mainly from urine, blood, and abdominal fluids among others, and some were from screening samples. After analyzing the virulence gene content, 76% of the isolates were considered ExPEC, although non-ExPEC isolates were also obtained from extraintestinal sites. Pan-genome phylogeny and clonal analysis showed great clonal diversity, although the first phylogroup in abundance was phylogroup A, harboring CC10 isolates, followed by phylogroup B2 with CC/ST131, mostly H30Rx, the subclone co-producing CTX-M-15. Phylogroups D, B1, C, F, and E were also detected with fewer strains. CC10 and CC/ST131 were found throughout the country. In addition, CC10 nucleated most metalloenzymes, such as NDM-1. Other relevant international clones were identified, such as CC/ST38, CC155, CC14/ST1193, and CC23. Two isolates co-produced KPC-2 and OXA-163 or OXA-439, a point mutation variant of OXA-163, and three isolates co-produced MCR-1 among other resistance genes. To conclude, in this work, we described the molecular epidemiology of carbapenemase-producing ExPEC in Argentina. Further studies are necessary to determine the plasmid families disseminating carbapenemases in ExPEC in this region.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Frontiers Media
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dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
CARBAPENEMASE
dc.subject
ESCHERICHIA COLI
dc.subject
EXPEC
dc.subject
HIGH RISK CLONE
dc.subject
PHYLOGENY
dc.subject.classification
Enfermedades Infecciosas
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dc.subject.classification
Ciencias de la Salud
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dc.subject.classification
CIENCIAS MÉDICAS Y DE LA SALUD
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dc.title
Carbapenemase-Producing Extraintestinal Pathogenic Escherichia coli From Argentina: Clonal Diversity and Predominance of Hyperepidemic Clones CC10 and CC131
dc.type
info:eu-repo/semantics/article
dc.type
info:ar-repo/semantics/artículo
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.date.updated
2023-04-26T14:48:55Z
dc.journal.volume
13
dc.journal.pagination
1-11
dc.journal.pais
Suiza
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dc.description.fil
Fil: Sanz, María Belén. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud ; Argentina
dc.description.fil
Fil: de Belder, Denise Gisele. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud ; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina
dc.description.fil
Fil: de Mendieta, Juan Manuel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud ; Argentina
dc.description.fil
Fil: Faccone, Diego Francisco. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud ; Argentina
dc.description.fil
Fil: Poklepovich, Tomás. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Lucero, Celeste. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud ; Argentina
dc.description.fil
Fil: Rapoport, Melina. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud ; Argentina
dc.description.fil
Fil: Campos, Josefina. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Tuduri, Ezequiel. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud ; Argentina
dc.description.fil
Fil: Saavedra, Mathew O.. Houston Methodist Hospital; Estados Unidos
dc.description.fil
Fil: Van der Ploeg, Claudia. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; Argentina
dc.description.fil
Fil: Rogé, Ariel Diego. Dirección Nacional de Instituto de Investigación. Administración Nacional de Laboratorio e Instituto de Salud "Dr. C. G. Malbrán"; Argentina
dc.description.fil
Fil: Pasteran, Fernando. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Corso, Alejandra. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina
dc.description.fil
Fil: Rosato, Adriana E.. University of California; Estados Unidos
dc.description.fil
Fil: Gómez, Sonia Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas; Argentina. Dirección Nacional de Institutos de Investigación. Administración Nacional de Laboratorios e Institutos de Salud. Instituto Nacional de Enfermedades Infecciosas; Argentina
dc.journal.title
Frontiers in Microbiology
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/url/https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2022.830209/full
dc.relation.alternativeid
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2022.830209
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