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dc.contributor.author
Urbieta, María Sofía
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dc.contributor.author
Rascovan, Nicolas
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dc.contributor.author
Castro, Camila Andrea
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dc.contributor.author
Giaveno, Alejandra
dc.contributor.author
Vazquez, Martín
dc.contributor.author
Donati, Edgardo Ruben
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dc.date.available
2023-04-25T13:57:13Z
dc.date.issued
2014
dc.identifier.citation
Una mirada más profunda dentro de los extremofilos: análisis del genoma de una nueva especie de arquea termoacidófila; X Congreso Argentino de Microbiología General; Mar del Plata; Argentina; 2014; 1-2
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/195232
dc.description.abstract
Copahue geothermal area is located on the Northwest corner of Neuquén, crowned by Copahue volcano (30000 m o.s.l. in Cordillera de los Andes). The constant volcanic activity has determined the extreme environments found in the area, specially the existence of many high-temperature, acidic, sulphur-reach ponds and hot springs. Such habitats are populated by extremophilic microorganisms well adapted to develop under hard physicochemical conditions and the lack of organic carbon sources. In acidic high temperature environments archaea are important members of the communities, however many of the species are yet unknown and uncharacterized. Acidianus copahuensis is a thermoacidophilic archaea (phylum Crenarchaeota, order Sulfolobales) that has been isolated from various hot springs in Copahue and, until now, not reported anywhere else. A. copahuensis is a facultative chemolithoautotroph that grows optimally at 75°C and pH 2.5. It is capable of autotrophic growth; aerobically using iron and different sulfur compounds as energy sources, and anaerobically using H2 and S as electron donors and Fe(III) or S as final electron acceptors. It can also grow heterotrophically using yeast extract or glucose. In this work we present the first analysis of the genome sequence of A. copahuensis, obtained using a whole-genome shotgun (WGS) strategy with a 454-FLX Titanium pyrosequencer. The draft genome is 2,454,023 bases in length and the G+C content is 35.63 mol%. According to RAST annotation a total of 2,548 coding sequences (CDSs) and 52 structural RNAs (49 tRNAs, 3 rRNA) were predicted. A 47% of the CDSs were classified as hypothetical proteins and 20% as known enzymes. The genome of A. copahuensis reveled specific genes that could be associated with the strains metabolic activities. The key enzymes for sulphur compounds oxidation described for other acidophilic archea, such as sulfur oxigenase-reductase (SOR) and thiosulfate-quinone oxidoreductase (TQO), were detected in A. copahuensis. Iron oxidation as an energy source was also represented in the genome by some of the fox cluster enzymes. A. copahuensis presents genes coding for proteins of the five major terminal oxidase complexes of Sulfolobales, so far reported in only two species. As regards autotrophic metabolism, carbon fixation through the 3-hydroxypropionate?4-hydroxybutyrate cycle could be inferred by the presence of the key enzymes of this pathway. An interesting discovery is the presence of genes encoding for arsenite oxidase (aioAB), not common in Sulfolobales. This could be related with the use of arsenite as an energy source or the arsenic bioremediation potential of A. copahuensis. The present analysis confirms the presence of key enzymes that allow A. copahuensis survival in the environmental conditions of Copahue and make it a good candidate for biomining of sulphide minerals. Further analysis would be required to for a better understanding of these archaea extreme metabolic features.
dc.format
application/pdf
dc.language.iso
eng
dc.publisher
Sociedad Argentina de Microbiología General
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.subject
ACIDIANUS COPAHUENSIS
dc.subject
THERMOPHILIC ARCHAEA
dc.subject
DRAFT GENOME
dc.subject
COPAHUE
dc.subject.classification
Biología Celular, Microbiología
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dc.subject.classification
Ciencias Biológicas
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dc.subject.classification
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
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dc.title
Una mirada más profunda dentro de los extremofilos: análisis del genoma de una nueva especie de arquea termoacidófila
dc.title
A deeper look into extremophiles: analysis of the draft genome of Acidianus copahuensis, a novel thermoacidophilic archaea isolated from Copahue geothermal area
dc.type
info:eu-repo/semantics/publishedVersion
dc.type
info:eu-repo/semantics/conferenceObject
dc.type
info:ar-repo/semantics/documento de conferencia
dc.date.updated
2023-03-02T18:49:07Z
dc.journal.pagination
1-2
dc.journal.pais
Argentina
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dc.journal.ciudad
Buenos Aires
dc.description.fil
Fil: Urbieta, María Sofía. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Rascovan, Nicolas. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Rosario. Instituto de Agrobiotecnología de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Castro, Camila Andrea. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; Argentina
dc.description.fil
Fil: Giaveno, Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Patagonia Confluencia. Centro de Investigaciones en Toxicología Ambiental y Agrobiotecnología del Comahue. Instituto de Biotecnología Agropecuaria del Comahue | Universidad Nacional del Comahue. Facultad de Ciencias Agrarias. Centro de Investigaciones en Toxicología Ambiental y Agrobiotecnología del Comahue. Instituto de Biotecnología Agropecuaria del Comahue; Argentina
dc.description.fil
Fil: Vazquez, Martín. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Rosario. Instituto de Agrobiotecnología de Rosario; Argentina
dc.description.fil
Fil: Donati, Edgardo Ruben. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Exactas. Centro de Investigación y Desarrollo en Fermentaciones Industriales; Argentina
dc.conicet.rol
Autor
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dc.coverage
Nacional
dc.type.subtype
Congreso
dc.description.nombreEvento
X Congreso Argentino de Microbiología General
dc.date.evento
2014-07-02
dc.description.ciudadEvento
Mar del Plata
dc.description.paisEvento
Argentina
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dc.type.publicacion
Book
dc.description.institucionOrganizadora
Sociedad Argentina de Microbiología General
dc.source.libro
Actas del X Congreso Argentino de Microbiología General
dc.date.eventoHasta
2014-07-04
dc.type
Congreso
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