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dc.date.available
2023-03-13T15:58:38Z
dc.identifier.citation
Chelaliche, Anibal Sebastian; Andreiu, Erika María Martha; Benitez, Silvana Florencia; Alvarenga, Adriana Elizabet; Zapata, Pedro Dario; Fonseca, Maria Isabel; (2023): Ensamble de novo del genoma de Pleurotus pulmonarius LBM 105. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. (dataset). http://hdl.handle.net/11336/190343
dc.identifier.uri
http://hdl.handle.net/11336/190343
dc.description.abstract
Here we present the de novo whole-genome assembly of the White-rot fungus Pleurotus pulmonarius LBM 105. The genome was assembled and annotated using the CLC workbench. Published in Mendeley data: https://data.mendeley.com/drafts/mbsx5b8vhm
dc.rights
info:eu-repo/semantics/openAccess
dc.rights.uri
https://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/2.5/ar/
dc.title
Ensamble de novo del genoma de Pleurotus pulmonarius LBM 105
dc.type
dataset
dc.date.updated
2023-03-13T15:00:27Z
dc.description.fil
Fil: Chelaliche, Anibal Sebastian. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales. Departamento de Bioquímica Clínica. Laboratorio de Biotecnología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste; Argentina
dc.description.fil
Fil: Andreiu, Erika María Martha. Universidad Nacional de Misiones; Argentina
dc.description.fil
Fil: Benitez, Silvana Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste; Argentina. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales. Departamento de Bioquímica Clínica. Laboratorio de Biotecnología Molecular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Alvarenga, Adriana Elizabet. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste; Argentina. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales. Departamento de Bioquímica Clínica. Laboratorio de Biotecnología Molecular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Zapata, Pedro Dario. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste; Argentina. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales. Departamento de Bioquímica Clínica. Laboratorio de Biotecnología Molecular; Argentina
dc.description.fil
Fil: Fonseca, Maria Isabel. Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales. Departamento de Bioquímica Clínica. Laboratorio de Biotecnología Molecular; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste; Argentina
dc.datacite.PublicationYear
2023
dc.datacite.Creator
Chelaliche, Anibal Sebastian
dc.datacite.Creator
Andreiu, Erika María Martha
dc.datacite.Creator
Benitez, Silvana Florencia
dc.datacite.Creator
Alvarenga, Adriana Elizabet
dc.datacite.Creator
Zapata, Pedro Dario
dc.datacite.Creator
Fonseca, Maria Isabel
dc.datacite.affiliation
Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales. Departamento de Bioquímica Clínica. Laboratorio de Biotecnología Molecular
dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste
dc.datacite.affiliation
Universidad Nacional de Misiones
dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste
dc.datacite.affiliation
Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales. Departamento de Bioquímica Clínica. Laboratorio de Biotecnología Molecular
dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste
dc.datacite.affiliation
Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales. Departamento de Bioquímica Clínica. Laboratorio de Biotecnología Molecular
dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste
dc.datacite.affiliation
Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales. Departamento de Bioquímica Clínica. Laboratorio de Biotecnología Molecular
dc.datacite.affiliation
Universidad Nacional de Misiones. Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales. Departamento de Bioquímica Clínica. Laboratorio de Biotecnología Molecular
dc.datacite.affiliation
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Nordeste
dc.datacite.publisher
Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas
dc.datacite.subject
Biología Celular, Microbiología
dc.datacite.subject
Ciencias Biológicas
dc.datacite.subject
CIENCIAS NATURALES Y EXACTAS
dc.datacite.date
03/02/2023
dc.datacite.DateType
Creado
dc.datacite.language
eng
dc.datacite.AlternateIdentifierType
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.17632/mbsx5b8vhm.2
dc.datacite.AlternateIdentifierType
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/ark/https://data.mendeley.com/datasets/94jg7jkt6n/1
dc.datacite.version
1.0
dc.datacite.description
The DNA was obtained from a 5 day mycellia grown on a liquid Malt Extract media using the protocol proposed by Fonseca et al. 2015. The DNA was sent to Macrogen, Korea for its sequencing. The reads were obtained using an Illumina Hiseq 3000 plataform. The quality of the reads was assessed using the FASTqc software. The CLC workbench and the CLC finishing module was used for the assembly and anotation of the genome. The de novo assembly was made using a 250 bubble size, a 40 word size, and a Minimun Contig Lenght of 1000. The annotations were extracted from a Pleurotus pulmonarius reference genome (PM_ss13_v1) using an annotation overlap and identity fraction of 0,8.
dc.datacite.DescriptionType
Métodos
dc.subject.keyword
GENOME
dc.subject.keyword
PLEUROTUS
dc.subject.keyword
WHITE ROT
dc.subject.keyword
DE NOVO ASSEMBLY
dc.datacite.resourceTypeGeneral
dataset
dc.conicet.datoinvestigacionid
5012
dc.conicet.justificacion
Pertenece a un cepario
dc.datacite.formatedDate
2023
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